게시 및 게시 날짜 : 2011/06/01

새로운 "Gate"Almatimonadettes

-"Phyla"수준에서 새로운 바카라 하는 법아를 이소화하고 배양하는데, 이는 바카라 하는 법아의 가장 높은 분류 클래스-

포인트

  • 수생 식물의 rhizosphere 환경에서 매우 독특한 계통 발생적으로 발견 된 바카라 하는 법아와 성공적으로 배양했습니다
  • 이 바카라 하는 법아는 "Phyla"수준에서 소설이며,이 바카라 하는 법아의 새로운 Phyla 대표자의 과학적 이름이 공식적으로 인정되었습니다
  • 새로운 Phylum에 속하는 바카라 하는 법아의 순수한 분리는 새로운 생물학적 기능의 발견으로 이어질 것입니다

요약

바카라 커뮤니티 (Nomaguchi Ari 회장) (이하 "AIST")생물학 프로세스 연구 부서[연구 부서 이사 Kamagata Yoichi] 생물학적 자원 정보 인프라 연구 그룹 연구원 인 Tamaki Hideyuki 연구원과 연구 그룹의 이사 인 Kamagata Yoichi는 공동으로 공동으로 Tanaka Yasuhiro, Yamanashi University (Environmental Engineparty)의 조교수로 알려져 있습니다 "야마 나시 대학교") 및 부교수, 모리 카즈 히로 (Mori Kazuhiro) 부교수YoshiRipterature우리는 환경에 살고 성공적으로 배양하는 매우 계통 발생적으로 독특한 바카라 하는 법아를 발견했습니다Phylogenetics에 대한 자세한 분석 후,이 바카라 하는 법아는 "게이트|"의 수준에서 새로운 발견으로 판명되었습니다 분석을 바탕으로 알마티 모나 데이트의 새로운 게이트 (Armatimonadetes)의 과학적 이름을 제안하는 국제기구 (International Organization)는 바카라 하는 법아의 이름을 감독합니다 (원핵 생물 체계의 국제위원회: ICSP)에 의해 공식적으로 인증되었습니다

이 새로운 게이트는바카라 하는 법아 도메인이것은 게이트의 28 번째 게이트입니다 이 Phyla 중에서, 23 개의 Phyla는 새로운 바카라 하는 법아의 발견 또는 분리 배양에 의해 인증되지 않았다; 2001 년에는 이미 여러 가지 순수한 바카라 하는 법아 분리주가 있었으며, 그들은 공식적으로 Phyla로 다시 인식되어 phylotaxonomic 프레임 워크로 재구성되고 재구성되면서 다시 한 번 Phyla로 인식되었습니다 이 연구가 본 연구에서와 같이 새로운 phylum을 제안하고 인식하는 것은 매우 드 rare니다

이 성과에 대한 자세한 내용은 영국 과학 저널 "국제 체계 및 진화 미생물학 저널(ijsem)의 6 월호에 실릴 예정입니다

그림 1 (왼쪽) 그림 1 (오른쪽)
그림 1 새로운 "Phyla"에 속하는 바카라 하는 법아Armatimonas Rosea9984_10009ijsem잡지에서

개발의 사회적 배경

미생물은 사케, 된장, 간장, 치즈 및 요구르트와 같은 발효 식품으로 예시 된 바와 같이 고대부터 인류에게 다양한 이점을 가져 왔습니다 또한, 항생제, 살충제 및 세제 효소를 포함한 다양한 제약이 다양한 미생물 자원에서도 발견되었습니다 그러나 최근에 이러한 유용한 물질을 생성하는 미생물이 지구 환경에 존재하는 소수의 미생물 중에서 만 발견되었다는 것이 분명해졌습니다

최근의 유전자 분석에 따르면 지구 환경, 지하, 바다 아래 및 대기로 광대하고 다양한 미생물이 존재하는 것으로 나타 났으며, 이들 중 99%는 아직 분리되고 배양되지 않은 알려지지 않은 미생물입니다 이러한 알려지지 않은 무 분류 미생물 중 다수는 기존 기술을 사용하여 배양하기 어려운 "강화 된 미생물"으로 간주됩니다 실제로, 일반적인 재배 방법을 사용하여 토양이나 강 샘플을 접종하고 재배하더라도, 이러한 환경에서 거주 해야하는 미생물은 전혀 자라지 않을 것입니다 이 알려지지 않은 문화하기 어려운 미생물은 사용되지 않는 생물학적 자원이며, 개발 될 수 있다면 제약, 식품 및 효소와 같은 생물 생산물의 발달을위한 시드가 될 것이며 생물 산업의 발달에 크게 기여할 것으로 예상됩니다

또한, 지구 환경에서 알려지지 않은 미생물을 분리하고 배양하고 새로운 생물학적 기능을 설명하는 것은 자연스럽고 생물학적으로 중요 할뿐만 아니라 세계 환경의 보존 및 복구를 지원하는 미생물의 미지의 기능을 설명하는 관점에서 전 세계적으로 중요한 공통적 인 연구 주제가되었습니다

연구 이력

AIST는 10 년 넘게 알려지지 않은 미지급 미생물 자원을 개발하는 기술을 개발해 왔습니다 이 기간 동안, 그들은 다양한 환경에서 다양한 미지의 미생물을 성공적으로 고립하고 재배했으며, 지금까지 지금까지 1 개의 새로운 계통 (이 발견은 포함되지 않음), 3 개의 새로운 수업 수업, 4 개의 새로운 계급 회원, 6 개의 새로운 가족 구성원, 23 개의 새로운 종족, 23 종의 새로운 종에 대한 과학적 이름을 제안했습니다

한편, 야마 나시 대학교 공학부 환경 공학부 (Department) 환경 공학부는 수년간 오리와 리드와 같은 수생 식물의 환경 정화 효과에 초점을 맞추고 있으며, 이들 식물의 정제 메커니즘을 설명하고 실제 수생 환경에서 수생 식물을 사용하는 물 정제 시스템을 개발해 왔습니다 특히, 수생 식물의 rhizosphere에 사는 미생물은 환경 정화에 기여하는 것으로 밝혀졌지만, 수생 식물의 뿌리 줄기에 실제로 어떤 종류의 미생물이 살고 있는지는 불분명합니다

따라서 AIST와 Yamanashi University는 수생 식물의 rhizosphere에 사는 미생물의 다양성과 기능을 설명하기 위해 공동 연구를 진행하고 있으며,이 연구의 결과는 연구 과정에서 얻었습니다

연구 컨텐츠

Duckweed, 뱀, 뱀, 뱀, 뱀, 뱀, 뱀, 뱀, 뱀, 배, 배아 및 배어와 같은 다양한 수생 식물은 수생 환경을 보존하는 데 중요한 역할을합니다 특히, 환경 오염 물질을 효율적으로 분해하고 제거 할 수있는 미생물의 존재는 이러한 rhizosphere 환경에서 알려져있다 그러나 수생 식물에서 rhizosphere 미생물의 다양성에 대한 연구는 거의 없으며, 어떤 종류의 미생물이 존재하는지의 기초는 명확하지 않습니다 따라서, 우리는 수생 식물에서 rhizosphere microorganism의 유전자 분석을 수행했으며, Duckweed, 부비동 부비동 및 갈대의 rhizospher에 매우 다양하고 알려지지 않은 미생물이 있음을 발견했습니다 우리 가이 시점까지 우리가 재배 한 기술, 지식 및 경험을 바탕으로, 우리는 수생 식물의 rhizosphere에서 알려지지 않은 미생물을 포괄적으로 탐구하며, 우리는 그들을 활성화시키기 위해 노력하고 있습니다 (Phragmites Australis)의 rhizosphere 환경에서 "Phyla"수준에서 새로운 바카라 하는 법아 균주 Yo-36의 순수한 분리가 성공적이었다 (도 2)

그림 2
그림 2 : 바카라 하는 법아는 새로운 Phyla로 분류Armatimonas Rosea갈대의 rhizosphere 환경에서 분리되었습니다
 

바카라 하는 법아의 분류 (바카라 하는 법아 도메인)는 상단에서 왔으며 Phylum (Phylum), leash (클래스), 눈 (가족), 가족 (Order), 속 (), 종 ()로 나뉘며 "Phyla"는 본질적으로 바카라 하는 법아에서 가장 높은 분류 클래스입니다 다시 말해, 새로운 계통 발생 학적 계통 발생 군에 속하는 것은 그것이 매우 새로운 바카라 하는 법아임을 나타냅니다 실제로,16S rRNA 유전자, 분자 계통 발생 학적으로 분석되었을 때,이 바카라 하는 법아의 16S rRNA 유전자 서열은 기존 바카라 하는 법아 종의 서열과 계통 발생 학적 OP10 (후보 Phylumop10)라는 유전자 정보에서 추론 된 후보 Phylum에 속한 것으로 밝혀졌습니다 (그림 3)

그림 3
그림 3 바카라 하는 법아에서 후보 phylum op10의 분자 계통 발생 위치 (바카라 하는 법아 도메인)

그 존재는 유전자 수준에서 추정되었지만, 후보 Phylum OP10은 바카라 하는 법아 종이 실제로 분리되고 배양되지 않았으며 과학적 이름이 나열되어 있지 않은 계통 그룹이었으며,이 기능은 불분명했다 OP10 후보 계통은 전 세계에서 가장 유명한 후보 계통 중 하나입니다이 phylum에 속하는 바카라 하는 법아에서 유래 한 것으로 생각되는 유전자는 전 세계의 다양한 환경 (예 : 토양, 강, 호수, 바다, 바닥 진흙, 식물 뿌리 줄기, 온천, 퇴비, 퇴비, 폐수 치료 심전도)에서 감지되었습니다 전 세계의 연구원들은이 후보 Phylum의 알려지지 않은 기능에 매우 관심이 있으며, 후보 Phylum OP10에 속하는 바카라 하는 법아의 순수한 분리는 미지의 기능을 설명하는 데있어 주요 획기적인 것 중 하나라고 생각되었습니다

우리가 이번에 발견 한 바카라 하는 법아 균주 Yo-36은 세포 크기가 약 16 µm, 길이 28 µm 인 타원형 또는 막대 모양의 바카라 하는 법아이며 (그림 1), 계통 낙코 닉 분석 결과에 기초하여 산소 호흡을 통해 자랍니다화학 합성 이종 영양 바카라 하는 법아입니다 이 바카라 하는 법아는 매우 제한된 유기물에서 이용 가능하며 펙틴, 젤란 검 및 크 산탄 검과 같은 중합체 유기물을 선호합니다 특히, 한천에서 재배 될 때, 그것은 매우 단단한 플라스틱과 같은 식민지를 형성하는 것이 특징이며, 새로운 phylum은 "Armatus"에서 시작되었습니다 또한, 광범위한 형태 학적, 생리 학적, 생화학 적, 분자 계통 발생 학적 분석이 수행되었으며, 공식적인 과학적 이름 "Almatimonadetes (Armatimonadetes Phyl 11 월) "그리고 새로운 Phylum almatimonadettes, 새로운 종, Almatimonas Rosea (Armatimonas Rosea gen 11 월, sp 11 월) "그리고 최근국제 체계 및 진화 미생물학 저널에 받아 들여지고 출판되었습니다 (그림 4) 이것은 바카라 하는 법아를 포함한 원핵 생물의 계통 발생 학적 분류 명명을 감독하는 국제위원회 (원핵 생물 체계의 국제위원회: ICSP)에 의해 인증되었음을 의미합니다

그림 4
그림 4 새로운 게이트Armatimonadetes및 Phyla의 표준 바카라 하는 법아Armatimonas Rosea
   바카라 하는 법아 내의 분자 계통 발생 위치 (바카라 하는 법아 도메인)ijsem잡지에서
   이 분자 계통 발생 수는 16S rRNA 유전자 서열 정보에 기초하여 만들어졌다

지금까지 계통 발생 학적 OP10에 속하는 미생물은 "강화 된 미생물"이 될 것으로 예상되었지만, 적어도 우리가 발견 한 바카라 하는 법아 Yo-36 균주는 "강화 된 미생물"이 아니었다 대장균 및 바실러스 서브 틸리와 같은 쉽게 배양 된 바카라 하는 법아와 비교할 때,이 바카라 하는 법아는 느리고 다루기가 어렵지만, "재배되지 않는"것은 아니며 평소보다 조금 더 긴 영양소 농도로 한천 매체에서 배양하면 쉽게 자랄 수 있습니다 우리는 우리가 전혀 배양되지 않은 Phylum OP10에 속하는 바카라 하는 법아를 성공적으로 분리하고 배양 할 수 있었던 주된 이유는 우연의 일치, 독창성 및 경험 외에도 바카라 하는 법아 분리의 공급원으로서 수생 식물의 뿌리 줄기에 초점을 맞추었기 때문입니다 미생물은 수생 식물뿐만 아니라 식물의 뿌리에서 공급 된 다양한 물질에 의해 수생 식물뿐만 아니라 rhizosphere 환경에서 활성화되는 것으로 알려져 있지만, 바카라 하는 법아 Yo-36 균주는 또한 뿌리 줄기 환경에서 활성화되어 배양 할 수있게 된 것으로 추측된다 토양 또는 강물 샘플이 바카라 하는 법아의 공급원으로 재배 되더라도 많은 환경에서 살아가는 것으로 알려진 배양 바카라 하는 법아에는 거의 불가능하지만,이 연구에서는 많은 수생 식물에 사는 바카라 하는 법아가 자주 배양하여 위의 가설을지지 할 수 있다고 생각합니다

이 발견은 이전에 추정 된 분류군이었던 OP10 후보 계통에 속하는 분리되고 배양 된 바카라 하는 법아가 과학적 이름으로 나열된 종으로 제안되었으며,이 후보자에게 공식적인 과학적 이름을 제안하고 인증을 받았지만,이 후보, 물리적, 그리고 생명의 지식에 대한 중요한 결과이기도합니다 이 연구에서와 같이, 미지의 바카라 하는 법아의 순수한 분리를 통해 새로운 phylum이 제안 된 것은 매우 드 rare니다이 연구 외에는 전 세계에 4 건만 있습니다 바카라 하는 법아 도메인 단독에는 OP10 후보 계통과 같은 100 개가 넘는 추정 후보 계통이 있지만 지금까지는이 후보 계통에 속하는 순수한 분리 물이 얻어지지 않았으며, 이들의 기능은 알려지지 않았다

미래 계획

현재, 우리는 Yamanashi University 독립 행정 기관 제품 평가 기술 인프라 기관 및 공립 대학 법인 Ishikawa 현 대학과 협력하여 바카라 하는 법아 변형 Yo-36의 게놈 분석을 수행하고 있습니다 앞으로, 우리는 그것으로부터 얻은 게놈 정보에 기초하여 새로운 계통 발생 학적 계통 발생학에 속하는 바카라 하는 법아의 새로운 생물학적 기능을 명확히하고자한다 또한 새로운 Phylum almatimonadetes는 바카라 하는 법아에서 비교적 오래된 분지 분류군 일 수 있으며, 미생물 계통 및 진화를 고려하여 매우 중요한 발견을 할 것으로 예상됩니다 또한, 우리는 수생 식물 rhizosphere의 Phylum almatimonadetes에 속하는 바카라 하는 법아의 생태 학적 역할과 환경 클렌징 기능을 조사하고 수생 식물과 뿌리 줄기 미생물 사이의 생물학적 상호 작용에 대한 연구를 조사하고자합니다


터미널 설명

◆ 예
공식 과학 이름은 "Phragmites Australis""전 세계의 아광에 널리 분포되어 있으며 일본에 전국적으로 분포되어있는 잔디 가족의 다년생 식물입니다 특히 Lakeshores, Lower Rivers 및 Wetlands, 최근 3M 이상의 수준에서 도달하는 수준에서 Reeds Where, Fore and where and where and alls and where in where in where in where in where and where and awreds in where in where 유기체, 또한 수생 구역을 보존하고 복원하기위한 장소로서의 관심을 끌고 있습니다[참조로 돌아 가기]
◆ Ripterature
rhizosphere는 식물 자체의 뿌리와 주변 환경을 말하며 식물과 미생물이 서로 적극적으로 영향을 미치는 환경입니다 식물은 뿌리를 통해 수분과 영양소를 흡수하지만 뿌리 표면에서 미생물의 성장에 필요한 산소, 영양소, 성장 촉진 물질 등을 공급하는 것으로 알려져 있습니다 실제로, 미생물은 뿌리 주위에 높은 세포 밀도를 가지며, 이는 식물에 다양한 영향을 미칩니다 그러한 환경에 사는 미생물을 rhizosphere microorganism이라고합니다[참조로 돌아 가기]
◆ Phylogenetics
생물학적 진화의 관점에서 살아있는 유기체의 친화력을 밝히고 분류하는 훈련 계보는 진화의 경로를 말하며, 유기체간에 다른 특성을 기반으로하고 유기체의 관계를 나타내는 경로를 따릅니다 최근 몇 년 동안, 방법은 계통 발생 학적 분류 지표 (예 : 리보솜을 암호화하는 유전자)로서 작용하는 유전자의 서열 정보에서 유기체의 유사성과 밀접한 관계를 조사하기 위해 널리 사용되었다 바카라 하는 법아의 경우, 계통 발생 학적 정보는 단일 표준으로 사용되며 계통 발생 학적 분류는 다양한 다른 특성 (예를 들어, 성장 온도, 성장 pH 범위 및 성장에 사용되는 화합물의 차이와 같은 광범위한 품목의 비교 결과)를 기반으로 수행됩니다[참조로 돌아 가기]
◆ Gate (Phylum)
17801_17969[참조로 돌아 가기]
◆ 바카라 하는 법아 도메인
바카라 하는 법아는 분류 영역 중 하나입니다 도메인은 분류 학적 용어로 가장 높은 분류 클래스이며 지구상의 모든 생물은 바카라 하는 법아 (바카라 하는 법아), 고풍 (고고) 및 진핵 생물 (진핵 생물)의 세 가지 영역으로 나뉩니다 인간, 동물, 식물, 곰팡이 및 효모는 모두 진핵 생물 (진핵) 도메인으로 분류됩니다 바카라 하는 법아와 고풍은 원핵 생물이라고 불립니다 바카라 하는 법아는 지구상의 모든 종류의 환경에 살고 있으며 토양, 강, 호수 및 해양 환경뿐만 아니라 깊은 지하 및 열수 환경과 같은 극단적 인 환경에서도 존재하는 것으로 확인되었으며 세계 환경을 보존하고 복원하는 데 중요한 역할을합니다[참조로 돌아 가기]
◆ 16S rRNA 유전자
이것은 세포 내 소기관 인 리보솜에 함유 된 RNA 가닥을 암호화하는 유전자의 서열이며, 바카라 하는 법아에는 약 1,500 개의 염기의 서열이 있습니다 리보솜 RRNA 유전자 (16S rRNA 유전자 또는 18S rRNA 유전자)는 모든 유기체에 존재하며 이들의 진화 속도는 상대적으로 느리므로, 분자 클록으로 널리 사용되며, 연관성 및 계통 발생 학적 진화 거리 (종의 구절)를 추정합니다[참조로 돌아 가기]
◆ 화학 합성 이종 바카라 하는 법아
자라거나 자랄 때 탄소 공급원으로 설탕, 아미노산 및 지방산과 같은 유기 화합물을 필요로하는 바카라 하는 법아를 이종 영양 바카라 하는 법아라고합니다 또한, 에너지 원으로 화학 물질을 사용하는 이종 영양 바카라 하는 법아를 화학 합성 이종 영양 바카라 하는 법아라고합니다 대조적으로, 에너지 원으로 빛을 사용하는 이종 영양 바카라 하는 법아를 광합성 이종 영양 바카라 하는 법아라고합니다 무기 화합물을 탄소 공급원으로 사용하고 에너지 원으로 무기 화합물 또는 빛을 사용하여 자라는 바카라 하는 법아를자가 영양 바카라 하는 법아라고합니다[참조로 돌아 가기]


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