Waseda University의 고품질의 대량의 데이터 및 바카라 분석 기술로 의학 분야의 혁신을 목표로

Waseda University의 고품질의 대량 데이터 및 바카라 분석 기술로 의학 분야의 혁신을 목표로합니다

2017/03/31

Waseda University의 고품질, 대량의 데이터 및 바카라 분석 기술의학 분야의 혁신을 목표로생물학적 시스템 빅 데이터 분석 오픈 혁신 연구소

❶바카라의 광범위한 분석 기술을 갖춘 Waseda University의 고품질의 대량의 데이터 융합
❷바이오 기반 및 정보 기반 시스템 모두 테마 설정 단계에서 작동합니다
❸현재 필요한 기술 외에도 우리는 미래에 대한 주목을 받아 도전적인 연구를 수행합니다

 

바카라는 University 캠퍼스에 공동 연구 센터 인 Open Innovation Laboratory (Oil)를 설립하여 바카라의 기본 연구를 산업을 목표로하는 기본 연구와 결합하기위한 목표를 세우고 있습니다 2016 년 7 월, Waseda University 캠퍼스에 업계 아카데미아 정부 협업 연구 센터 인 바카라 및 Waseda University Biological Systems Big Data Analysis Open Innovation Laboratory (CBBD-Oil)가 설립되었습니다 우리는 핵심 회원들에게 특정 연구 내용, 그들이 목표로하는 결과 및 향후 개발에 대해 물었습니다

기름이 설치 될 시간이 익었습니다

-프로모터 인 Nakamura 씨로서 Waseda University에서 오일이 어떻게 설립되었는지 알려주십시오

Nakamura (바카라)CBBD- 오일은 사립 대학에서 최초의 오일입니다 Waseda University는 생명 공학 분야에서 잘 알려진 많은 연구원들이있는 대학으로 해양 유기체에 대한 메타 게놈 데이터를 포함하여 풍부한 고품질 데이터를 보유하고 있습니다 또한 Waseda University와 바카라는 고급 생활 정보 분석 기술을 가지고 있습니다 우리는 이러한 연구 데이터를 기술과 결합함으로써 세계적 수준의 연구를 수행 할 수 있기를 희망하면서 생물학적 시스템 빅 데이터 분석을위한 석유를 설립했습니다

Takeyama (Waseda University)나는 다양한 종의 유전자 분석에 관여했지만 생명 정보 분석 기술을 습득하는 것이 바이오 기반 연구에 매우 중요하다고 생각하며,이를 제가 속한 바이오 의학 과학부의 수업에 포함 시키려고 생각했습니다 귀하의 제휴 관계가 생물 관련이더라도 일부 학생들은 Bio-Research에서 나오는 정보를 분석하는 데 관심이 있습니다 바카라의 생물 정보학 분석 연구원으로 그러한 학생들을 개발하는 방법에 대해 생각하고 있으며 교육뿐만 아니라 빅 데이터 분석과 같은 생물 정보학 연구가 함께 수행 될 수 있기를 바랍니다

세계의 차세대 시퀀서^*1의 출현으로 전례없는 양의 수명 정보와 빅 데이터가 생성되었습니다 그러나 특히 바이오 관련 빅 데이터를 분석 할 수있는 인원이 부족했습니다 내 주변 사람들도 마찬가지이며, 우리 자신의 필요와 씨앗을 고려할 때 상황을 고려하여 지금은 행동을 취할 시간이라고 생각합니다 Waseda University는 생명 공학에서 정보 기술에 이르기까지 광범위한 부서에서 광범위한 인재를 보유하고 있으며 분석 할 수있는 가치가 풍부한 바이오 다타를 보유하고 있습니다 바카라가 제안한 오일 스토리는 생물학적 시스템의 빅 데이터 분석과이를 촉진하는 다양한 조건에서 완벽한 상황에서 발견 될 수있는 기회였습니다

바이오 기반 및 정보 시스템을 결합하여 획기적인 것을 실현하고 싶습니다

-CBBD 오일의 전반적인 아이디어는 무엇입니까?

NakamuraWaseda University의 고품질 데이터 및 시퀀스 분석 알고리즘 기술과 바카라의 분석 기술을 결합하여 빅 데이터를 축적하고 분석하기위한 허브를 구축 할 것입니다 구체적으로, 목표는 큰 시퀀스 데이터에서 유용한 지식을 추출하는 정보 분석 기술을 개발하고이를 사용하여 생명 메커니즘을 밝히고 제약 및 건강 식품의 개발을 연결하는 것입니다

Takeyama삶의 정보 분석에 대한 이전의 연구는 종종 생명 공학과 정보 연구원들 사이의 목적과 의사 소통의 공유가 열악 해졌지만 CBBD 오일은 이러한 혁신을 달성하고 성공 사례로 만들기를 희망합니다

Yuya (바카라)이를 위해서는 실험 및 정보 분석 전문가의 기술과 수준에 적합한 연구를 수행해야합니다 CBBD-Oil에서, 양 당사자는 초기 단계의 연구 주제와 정책에 대해 협력하여 연구 목표의 이미지를 공유 할 수있는 시스템을 만듭니다

Hamada (Waseda University)이미 많은 양의 바이오 기반 데이터가 있지만 분석 기술 자체는 아직 충분하지 않습니다 제가 리더 역할을하는 시퀀스 분석 알고리즘 그룹은 최첨단 정보 기술, 수학, 물리 및 기타 분야에서 광범위한 지식인을 동원하고 분석 기술의 부족을 개발하기 위해 노력합니다

Tominaga (바카라)20 년 전과 달리, 데이터 및 정보 추출에 대한 관찰 정확도 및 분석 기술이 최근 몇 년 동안 실험 정확도가 향상되고 오류가 감소했으며 비용도 감소하고 누적 된 데이터가 증가했습니다 다른 많은 분야에서 비슷한 상황이 보이기 때문에 딥 러닝과 같은 빅 데이터 분석 분야가 등장했으며 다양한 새로운 분석 방법이 탄생하고 있습니다 CBBD- 오일은이 시점에서 정확히 전체 과학에서 다양한 것들을 다루어야 할 것입니다

다양한 재능, 다양한 연구는 그 강점입니다

-바카라와 Waseda University의 강점은 무엇입니까?

Yuya생물 정보학은 매우 광범위한 분야이며, 서열 분석, 3 차원 구조 분석 및 수치 분석을위한 완전히 다른 분야가 있습니다 바카라는 일본의 드문 조직으로 다양한 분야의 광범위한 생물 정보학 연구자이며 생물 정보학 연구를 처리 할 수없는 방법은 거의 없다고 말할 수 있습니다 이것이 바카라가 제공하는 것입니다 거기서 우리는 Waseda University가 보유한 데이터에 적합한 연구원을 검색하고 Bio 기반 데이터 분석의 기초가 될 알고있는 알고리즘 개발 전문가와 Tominaga와 같은 연구원과 실제 데이터 분석의 상용화에 가까운 나 자신과 함께 브리지를 구현하기 쉬운 시스템을 만듭니다

Takeyama게놈 시대에는 다양한 분야의 연구원들이 협력하지 않으면 연구 진전이 어려워지고 있습니다 Waseda University는 현재 바이오 관련 연구에 중점을두고 있으며 의료 및 기본 연구 연구원들은 교수진에 걸쳐 모입니다 학교의 중립 이미지는 의료 또는 약국에 있지 않으며 회사를 포함한 인적 자원과 정보를 축적하기 쉽다는 장점이 있습니다

우리는 CBBD 오일이 더 넓은 범위를 생성하기위한 플랫폼으로 기능하기를 바랍니다

우리는 또한 현재의 사회적 요구를 충족하는 동안 앞서 볼 수있는 연구를 취합니다

-어떤 종류의 연구를 수행하고 있습니까?

Yuya물론, 우리는 사회적 요구를 충족시키는 연구를 계속 수행 할 것이지만, 그 자체만으로는 충분하지 않습니다 우리가 삶의 미래 정보 분석의 표준이 될 기술을 만들지 않으면 생물 정보학은 미래가 없습니다 따라서 우리는 Hamada의 시퀀스 분석 알고리즘 팀에게 지금 유용한 것보다 더 어려운 연구를하도록 요청하고 있습니다 한편, Tominaga의 시스템 생물학 팀은 제약 및 생물학적 회사 및 의사와 밀접하게 관여하고 있으며 현재 현재 추구하고있는 응용 연구를 진행하고 있습니다

Hamada시퀀스 분석 알고리즘 팀은 배열에 중점을두고 있으며 장기적인 관점에서 기술 개발을 진행하고 있습니다 생물학적 데이터는 또한 DNA, RNA 및 단백질이 추상화 될 때 서열로 볼 수 있고, 많은 양의 해당 서열 데이터가 축적 될 수있다 우리는이를 효율적으로 처리하고 효과적인 통찰력을 발견하기 위해 새로운 방법론과 알고리즘을 만들려고 노력하고 있습니다

구체적으로, 그것은 많은 양의 문자열 데이터를 비교하고 처리하는 기술이며, 최근에 단백질이되지 않는 기술과 같이 단백질이되지 않는 RNA들 사이에서 발견 된 기술입니다^*2"의 기능을 정보로 추정하기위한 방법을 개발하고 있습니다 최근에, 우리는 또한 기계 학습 기술을 사용하여 내장의 대량의 박테리아의 메타 게놈 데이터를 분석하는 방법을 고안했습니다

Tominaga저의 관심은 생명체의 메커니즘을 완전히 이해하는 것이 아니라, 관찰 된 행동을 수학적으로, 생명체가 언제, 어떻게 행동하는지 설명하는 것입니다 예를 들어, 사람의 유전자의 작업 스타일을 측정 할 때 약 50,000 개의 유전자의 활동이 숫자 목록으로 나타나며, 그 의미만으로는 의미를 이해하기에 충분하지 않습니다 따라서 실제 분석 중에 유전자 그룹과 기능을 사용하여 작업 스타일을 포착하고 기능 간의 관계를 조사합니다 다시 말해, 우리는 분자 기계 자체로서의 삶의 메커니즘보다는 인간이 이해할 수있는 프레임 워크로 추상화 된 시스템을 탐구합니다

멤버십 등록은 연구 결과를 회사에 더 쉽게 연결할 수 있도록합니다

-회사가 협력하는 방식에 대해 어떻게 생각하십니까?

Takeyama현재 CBBD- 오일은 주로 제약 회사와 식품 산업과 같은 인간 건강과 관련된 회사에 관여하고 있습니다 세포 생물학에서 분자의 움직임을 알면 그것들을 통제하는 방법에 대한 연구로 이어지므로 질병 메커니즘과 같은 주요 수명 현상을 분석해야합니다

Hamada최근 몇 년 동안 철저히 분석 된 단백질 대신 비 코딩 RNA의 기능을 추정하기 위해 기술이 만들어 질 수 있다면, 제약이 미래에이를 대상으로 할 것으로 예상됩니다

Tominaga나는 주로 우리가 사용할 수있는 기술을 사용하여 분석하고 있지만, 어떤 수준에서 앞서 언급 한 추상화 수준을 선택할 수 있습니다 협력하는 회사가 이해에 관심이있는 깊이는 연구의 목적과 기간에 따라 다르지만, 이는 추상화 될 수 있으며 살아있는 유기체 기능의 분석 결과는 상대방이 해석하기 쉬운 방식으로 나눠 질 수 있습니다 이를 통해 회사는 예를 들어 이러한 미생물을 수정하여 제공 할 수있는 기능과 의약품을 만드는 방법과 같은 지침을보다 쉽게 ​​만들 수 있습니다

Nakamura석유는 기본 연구에서 브리징에 이르기까지 모든 것을 수행하는 연구 센터입니다 우리는 앞으로 참여하는 회사의 수를 늘리고 싶습니다

Yuya예를 들어, 회사에 게놈 부서를 설립하더라도 게놈 분석에 대해 지식이있는 사람들이 있다는 보장은 없으며 게놈 분석을 넘어서 수치 데이터를 처리 할 곳이 거의 없습니다 CBBD- 오일은 회사가 측정 한 실제 데이터를 사용하여 분석 할 수 있습니다 오일로 개발 된 새로운 분석 기술과 연구 결과에 대해 배울 수도 있습니다 무엇보다도 최첨단 생물 정보학 기술을 시험해 볼 수있는 지침과 상담을받을 수도 있습니다

Takeyama거기서부터 공동 연구를 시작할 수 있으므로 많은 회사들이 회원으로 등록하고 CBBD 오일에 참여하기를 원합니다

학생들도 RA 시스템을 사용하여 참여합니다

Takeyama현재 CBBD-Oil의 실험실에는 12 ~ 13 명의 학생이 있습니다 6 명의 대학원생 바카라 연구 조교 (RAS), 4 명의 기술 연수생 및 기타 학부생들도왔다 갔다했습니다 바카라의 RA 시스템을 사용하여 대학원생을 고용하는 이유는 학생들이 자신의 연구에 몰입 할 수있는 환경을 제공하기 때문에 학생들은 연구 결과를 달성해야합니다 이런 종류의 매칭은 매력적이며 학생들이 연구 주제를 넓히도록 도와줍니다 현장에서 활동하는 젊은 활력은 우리에게도 좋은 영감입니다

NakamuraRA는 연구 조교가 아니라 본격적인 연구원으로 취급됩니다 많은 사람들이 연구를 수행하고 훌륭한 결과를 얻기 위해 주도권을 잡기를 바랍니다

결과를 달성하고 국제 인정을 높이고 싶습니다

-향후 CBBD 오일은 무엇을 개발합니까?

Takeyama석유는 5 년간의 설치 마감일이지만 출시 후 9 개월 후 참가자들이 비전을 공유 할 기초가 있으며 많은 아이디어가 등장했습니다 우리는 미래에 훌륭한 결과를 달성하기위한 출발점으로 성장할 수 있기를 희망하며 석유가 끝난 후에도 보존하고자하는 연구 센터가되기를 바랍니다

Yuya이 연구 센터가 지금부터 5 ~ 10 년 동안 독립적으로 운영 되려면 회사와의 공동 연구를 적극적으로 늘리고 석유에 참여해야합니다 우리는 또한 전 세계에 흩어져있는 Bioinformatics Research Institutes 및 Biotechnology Research Institutes와의 국제 협력을 촉진하여 국제적으로 인정받는 조직으로 만들고 싶습니다 먼저, 좋은 종이를 게시하고 회사에 결과를 축적해야합니다

HamadaCBBD 오일의 정보 분석 기술을 남겨두고 싶습니다

Nakamura나는 높은 희망을 가지고 있습니다 우리는 외부 자금을 활용하고자하며 프로젝트가 완료된 후 회사의 제약 및 건강 식품의 개발을 연결하는 방식으로 얻은 지식을 개발하고 싶습니다

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*1 : 유전자 DNA 단편 (NGS)의 기본 서열을 읽을 수있는 장치 다수의 배열을 동시에 동시에, 병렬로 읽을 수 있습니다[참조로 돌아 가기]
*2 : 단백질로 번역되지 않은 독특한 기능성 RNA (비 코딩 RNA, NCRNA)[참조로 돌아 가기]