국립 선진 산업 과학 기술 연구소의 생물 정보학 연구 기관인 생물 정보학 연구 센터 (회장 : Yoshikawa Hiroyuki), 독립 행정 기관 [감독 : Akiyama Yasushi]전산 생물학 연구 센터, 바카라 사이트 추천 CBRC] 및 NEC Corporation (사장 겸 CEO : Nishigaki Koji, NEC)은 최근 바카라 사이트 추천 CBRC가 소유 한 생물 정보학을위한 가장 큰 병렬 PC 클러스터 시스템 중 하나를 보유 할 것이라고 발표했습니다Linpack벤치 마크 테스트 (주 1)with 654gigaflops (gflops)Pentium프로세서가 장착 된 상업용 PC 서버가있는 클러스터 시스템으로 세계 최고 컴퓨팅 성능을 달성(주 2)나는 그것을했다

이 시스템은 바카라 사이트 추천 CBRC에 의해 설치된 1,040 CPU가있는 대규모 PC 클러스터 시스템이며 각 노드는 NEC의 "Express5800 시리즈의 얇은 랙 마운트 서버를 기반으로, 노드 간의 상호 연결은 초당 4 기가비트입니다 (gbps) 고속 커뮤니케이션Myrinet(Millinet) (참고 3)를 사용합니다

또한, 메모리에서 많은 양의 수명 정보 데이터베이스를 직접 처리하라는 요청으로 인해 시스템에는 시스템 전체에 532 기가 바이트 (GB)가 장착되어 있으며보다 효율적인 병렬 처리를위한 시스템 소프트웨어이며 이제 더욱 효율적인 병렬 처리를 달성하기위한 시스템 소프트웨어로 사용할 수 있습니다실제 컴퓨팅 파트너십, 아래 : "점수(Escore)클러스터 시스템 소프트웨어 "(주 4)

이 클러스터 시스템은 "magi(Magi) 시스템 "바카라 사이트 추천의 고급 정보 계산 센터 (주 5)내에 설치 및 작동하며 바카라 사이트 추천의 Rinkai 하위 센터를 기반으로 바카라 사이트 추천 CBRC의 네트워크를 통해 독점적으로 사용됩니다

사용의 주요 영역에는 분자 시뮬레이션, 게놈 정보의 유전자 발견 및 이미지 처리를 통한 분자 구조 분석이 포함되며, "생물 정보학 공동 연구 [NEC, 2001 년 8 월 6 일의 보도 자료"의 핵심 플랫폼으로도 사용됩니다

최근 몇 년 동안 PC, PC 서버 등과 같은 여러 노드를 연결하여 네트워크를 통해 여러 노드를 연결하여 병렬 처리를 수행하는 PC 클러스터 시스템은 노드 및 네트워크의 성능이 향상됨에 따라 성능을 크게 향상 시켰습니다 게놈 분석 및 단백질 구조 분석과 같은 다량의 데이터를 검색하고 분석하기위한 고속 처리가 필요한 생물 정보학에서 PC 클러스터 시스템이 활발하게 도입되고 있습니다 이번에 기록 된 654 기가 플롭 (GFLOPS)의 실제 측정 성능은 PC 클러스터입니다SuperComputerBioinformatics의 추가 사용 촉진 가능성을 열어줍니다 그리고 수천 대의 초대형 클러스터 시스템의 미래 실현을 위해

바카라 사이트 추천 CBRC와 NEC는 세계에서 가장 빠르고 가장 고급 PC 클러스터 시스템을 계속 활용할 것입니다bioinformatex우리는 현장에서 공동 연구를 적극적으로 홍보 할 계획입니다

바카라 사이트 추천 CBRCmagiSystem/ 　Express5800 병렬 PC-Cluster

(주 1) Linpack 벤치 마크 테스트

가장 표준적이고 널리 사용되는 슈퍼 컴퓨터의 계산 성능을 비교하기 위해 생성 된 벤치 마크 중 대규모 선형 방정식을 해결할 때 계산 성능 (기가 플롭 값 : 참고 2)을 측정하십시오 이것은 J Dongara 박사 (테네시 대학교)가 제안했습니다[참조로 돌아 가기]

(주 2) Gflops

1 Gigaflops는 초당 10 억 개의 부동 소수점 작업을 수행하는 기능을 나타내는 용어입니다 이번에는 약 3 시간입니다Linpack프로그램이 실행되면 654 개의 기가 플롭 또는 평균적으로 654 억 개의 부동 소수점 작업이 초당 654 억 개의 플로팅 포인트 작업을 기록했습니다
이 성능은 올해 6 월의 글로벌 슈퍼 컴퓨터 성능 순위입니다TOP500(*)의 30 위에 해당합니다
(*)TOP500전 세계에 설치된 슈퍼 컴퓨터와 같은 대규모 컴퓨터 시스템의 데이터를 수집하고 www 웹 사이트뿐만 아니라 순위와 함께 상위 500 대의 컴퓨팅 성능을 소개하는 테이블입니다 1993 년 현재 형태로 출시되었으며 1 년에 두 번 업데이트됩니다 계산 성능 비교를 위해Linpack벤치 마크를 사용합니다 (주 1)
(참조 웹 사이트http : //wwwtop500org/)[참조로 돌아 가기]

(주 3)Myrinet(Millinet)

USAMyricom(Millicom)에 의해 개발 및 판매 된 네트워크 4Gbps에서 고속 통신이 가능하며 (2Gbps 통신 속도는 양방향 통신에 사용할 수 있음) 클러스터 시스템에 대한 상호 연결로 널리 사용됩니다[참조로 돌아 가기]

(주 4)점수(Escore)

RWCP가 개발 한 PC 클러스터를위한 병렬 운영 체제 클러스터 시스템에서점수노드 간의 효율적인 상호 통신과 여러 사용자의 병렬 프로그램의 시간 공유 실행을 가능하게합니다[참조로 돌아 가기]

(주 5) 바카라 사이트 추천 고급 정보 계산 센터 TACC (Tsukuba Advanced Computing Center)

바카라 사이트 추천 내의 공유 컴퓨터 센터 및 고성능 컴퓨팅 기술 연구원도 포함하는 조직
"magiSystem "은 바카라 사이트 추천의 Rinkai Sub-Centre (Koto-Ku, Tokyo) 내에 위치한 바카라 사이트 추천 CBRC의 생물 정보학 연구에 전념하고 있지만 TACC (Tsubba City, Ibaraki 현) 내에 설치되어 있으며 TACC에서 공동으로 관리됩니다[참조로 돌아 가기]