농업 및 생물학적 자원 연구소는 국립 선진 산업 과학 기술 연구소, 국립 정보 연구소, 국립 바카라 사이트학 연구소, 국립 산업 과학 및 기술 연구소, 국립 고급 산업 과학 연구소, 국립 바카라 사이트학 연구소쌀 주석 프로젝트(일반적으로 랩으로 알려짐) 및 모노 코트 공장게놈모든 염기 서열에 존재하는 29,550 개의 유전자의 위치를 결정했으며,이를 기반으로 바카라 사이트 유전자 수는 약 32,000으로 추정되었다 이 수는 이전에 예상보다 작으며, 게놈 크기가 바카라 사이트 약 3 분의 1 인 26,000-27,000 아라비돕시스 (Dicotyledons)에 비해 크지 않다는 것을 나타냅니다
또한 쌀 게놈의 28,540 개 바카라 사이트자가 단백질 생성 바카라 사이트자 일 가능성을 밝혀 냈으며, 컴퓨터 정보 분석 및 전문가 데이터 검사를 통해 이들 단백질의 기능을 추정했으며 19,969 (대략 70%) 바카라 사이트자의 기능을 설명 할 수있었습니다 이 정보는 데이터베이스 (http : //rapdbdnaaffrcgojp/andhttp : //rapdblabnigacjp/)
바카라 사이트 전체 게놈 서열의 완전한 해독은 2004 년 12 월에 완료되었지만 게놈 서열 자체는 단지 4 가지 유형의 ATGC 염기 목록 일뿐입니다 미래의 연구를 발전시키기 위해서, 게놈 염기 서열에 어디서 어떤 종류의 유전자가 존재했는지와 같은 생물학적 정보를 명확히해야했다 이 결과는 향후 쌀 연구 홍보에 크게 기여할 것으로 예상됩니다
덧붙여서, 위의 국제 공동 프로젝트는 교육, 문화, 스포츠, 과학 기술의 과학 및 기술 홍보 조정 비용을 지원함으로써 수행되었으며,이 결과는 미국 과학 저널의 결과였습니다게놈 연구(Genome Research)는 잡지에 출판되며 1 월 9 일 오전 7시 (일본 시간)에 출시 될 예정입니다
쌀 (Nihonbare) 게놈모든 기본 시퀀스이 프로젝트는 10 개국과 지역이 참여하고 1997 년에 시작된 국제 공동 프로젝트입니다이 프로젝트에서 농업 및 생물학 자원 연구소 (Biology Resource) 연구소는 일본의 주요 과학 정책 중 하나로 수행되었습니다 2004 년 12 월, 전체 쌀 게놈 서열은 완전히 해독 된 것으로 선언되었으며 2005 년 8 월에 선언되었습니다자연논문이 저널에 게시되었습니다 (주 1) 그러나, 게놈 염기 서열 자체는 단지 4 가지 유형의 ATGC의 목록 일 뿐이며, 향후 연구를 진행하기 위해 게놈 염기 서열에 어디에 위치되는지와 같은 생물학적 정보를 명확히해야한다 이 순서에 대한 생물학적 정보를 제공Anotation라고하며 게놈 정보를 효과적으로 사용하는 데 필수적인 작업입니다
9523_9724쌀 주석 프로젝트, 일반적으로 랩으로 알려진) 이 프로젝트는 12 개국 및 지역, 총 35 개의 연구소와 협력하여 수행되었으며, 아시아 국가 (일본, 중국, 대만, 인도, 태국), 쌀 게놈 전체 시퀀싱 프로젝트의 구성원 인 아시아 국가 (일본, 중국, 대만, 인도, 태국)의 연구원들 외에도 바이오 인플레이션 분석에서 광범위한 경험을 가진 3 개의 주요 핵형 서열 데이터베이스 (쌀 게놈 전체 시퀀싱 프로젝트)의 회원 인 미국 및 프랑스의 연구원들 외에도 실행되었습니다 생물 정보학 및 국립 생명 공학 정보 센터GenBank)와 같은 전문가로 구성됩니다 위에서 언급 한 국제 공동 프로젝트는 교육, 문화, 스포츠, 과학 기술의 과학 기술 홍보 조정 연방 서비스부의 지원으로 시행되고 있습니다
전체 염기 시퀀스를 결정하는 것은 매우 중요한 출발점이지만, 기본 서열 자체는 4 가지 유형의 염기 목록이며, 수명 현상을 이해하고 이해하기 위해서는 순서에 포함 된 바카라 사이트자 정보의 기능을 명확하게해야합니다 다시 말해, 생물학적 연구의 경우 기본 서열의 어떤 부분이 어떤 역할을하는지 명확히하기 위해 주석이 필수적입니다 한편, 생물학적 연구 연구소는 신뢰할 수있는 바카라 사이트자의 존재의 증거입니다전장 cDNA(주 2) 따라서,이 연구는 이러한 전장 CDNA를 최대한 활용하여 바카라 사이트자좌를 정확하고 안전하게 결정하고 게놈과 게놈을 사용합니다cDNA의 기본 서열을 비교하기 위해 대규모 계산이 수행되었습니다 쌀 바카라 사이트자좌를 자세히 결정합니다
우리는 이제 전체 쌀 게놈 서열에서 바카라 사이트자의 위치를 확인하고 29,550 개의 바카라 사이트자의 위치를 결정하여 28,540 명이 단백질 바카라 사이트자 일 수 있음을 밝혀냈다 일반적으로 컴퓨터를 사용하여 자동 처리하여 많은 경우에 결정된 바카라 사이트자에게 기능 정보가 제공됩니다 그러나 자동 처리에는 종종 부정확 한 정보가 포함되므로 신뢰할 수있는 데이터베이스를 구축하기 위해서는 전문 지식이 수정하는 큐 레이션이 필수적입니다 그러나 전체 쌀 게놈과 같은 많은 수의 바카라 사이트자가 포함되면 검증 될 데이터도 엄청납니다 따라서 우리는 쌀과 데이터베이스 건설에 대한 전문 지식을 가진 연구원들을 모아서 단기간에 한 번에 큐 레이션을 확인하기 위해 국제 회의를 조직했습니다 이 "Rine Annotation Conference"는 2004 년 12 월 전기 농가, 농업, 임업 및 어업 연구 및 전산 센터 (Tsukuba City)에서 열렸으며 약 90 명의 국내 및 국제 연구원이 참여했습니다 이 회의는 주석과 관련하여 쌀 바카라 사이트자 ID의 형식을 결정하는 것을 포함하여 큐 레이션을 수행했으며, 위에서 언급 한 쌀 바카라 사이트자의 19,969 (약 70%)의 기능을 자세히 설명했습니다 이 모든 결과는 향후 쌀 연구의 개발을 극대화하기 위해 다음 URL에서 RAP-DB (Rice Annotation Plan Database)로 이미 출판되었습니다http : //rapdbdnaaffrcgojp/andhttp : //rapdblabnigacjp/
바카라 사이트 유전자의 수는 게놈 시퀀싱의 초기 단계에서 약 50,000이 될 것으로 예상되었다 이 숫자는 디코 타일의 전형적인 연구 자료 인 애기 장대의 유전자 수 (주 3)의 수보다 약 2 배입니다 이것은 단일 코티 클론 인 쌀에 많은 수의 특정 유전자가있을 수 있지만, 다른 한편으로는 초기 유전자 수 추정은 컴퓨터 예측에 따라 다르며 오류가있을 수 있음이 또한있었습니다 따라서 이번에는 CDNA의 유전자 정보를 사용하여 다시 조사했으며 유전자의 수가 29,550이고 유전자좌도 결정되었다는 것을 발견했습니다 그러나, 모든 cDNA를 실험적으로 포착하는 것은 불가능하며, 이것을 고려하여, 실제 유전자 수는 약 32,000으로 추정되었다 또한이 숫자는번역되지 않은 RNA 바카라 사이트자(131은 번역되지 않은 RNA에 대한 잠재적 후보 만 발견하더라도 발견되었다), 단백질 바카라 사이트자는 훨씬 더 작다 고 생각된다 따라서 아라비돕시스에 비해 매우 많은 바카라 사이트자가 있다고 생각되지 않습니다 한편, 쌀 속과 유사한 서열이 발견되었고, 계통 특이 적으로 생각 된 5,663 개의 바카라 사이트자도 발견되었다 이 바카라 사이트자가 쌀에서 수행하는 기능의 유형은 매우 흥미로운 질문이며, 우리는 향후 기능 분석을 기대하고 있습니다
참고 1 :http : //wwwnaturecom/nature/journal/v436/n7052/abs/nature03895html
참고 2 :http : //wwwsciencemagorg/cgi/content/abstract/301/5631/376
참고 3 : Tair (http : //wwwarabidopsisorg/)에 게시 된 데이터에서
대량으로 확인 된 쌀 유전자는 정보 분석을 통해 크게 추정 될 수 있었지만 추가 실험적 검증이 필요합니다 다행스럽게도 생물학 연구소를 포함한 전 세계의 연구 기관은 쌀 유전자 기능 분석을위한 쌀 연구 자원을 개발하고 있으며, 특히 대량의 유전자 파괴 균주의 생성은이 목표를 달성하기위한 강력한 수단을 제공합니다 이번에 발표 된 주석 데이터 (새로운 데이터가 서로 추가되고 있음)에는 유전자 파괴 유전자가 파괴되는 방법과 연구 자원을 얻을 수있는 위치에 대한 정보도 포함되어 기능 분석을위한 정보 플랫폼이됩니다 바카라 사이트 게놈 정보는 쌀뿐만 아니라 주요 관련 잔디 곡물에 대한 연구를위한 귀중한 연구 자료 인 표준입니다 실제로, 게놈 시퀀싱 및 전장 cDNA 시퀀싱 프로그램은 또한 밀과 옥수수로 국제적으로 수행되고 있으며, 이들 곡물 뉴클레오티드 서열의 주석은 쌀에 따라 수행된다 이번에 발표 될 주석 데이터와 주석 생성 기술이 다른 종에 적용될 것으로 기대됩니다
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| 공개적으로 출판 된 쌀 게놈 주석의 일부 |