게시 및 게시 날짜 : 2008/08/18

검은 색 바카라 족보의 초안 게놈 분석

포인트

  • 오키나와의 Awamori와 Kyushu의 Shochu 제조에 사용되는 검은 바카라 족보바카라 족보시퀀스를 해독하십시오
  • 일본의 전통적인 산업 미생물Kojimpanicum
  • 유용한 물질 생산,Biomass의 효과적인 사용을 포함하여 생명 공학에 적용하기를 기대합니다
  • 우리는 또한 오키나와 현과의 협력을 통해 지역 산업의 홍보 (품질 향상, 부가 가치 등)를 기대하고 있습니다

요약

일본 제품 평가 기술 연구소 (NITE)는 "Black Koji Fungus Genome Analysis Consortium"과 협력하고 있으며, 이는 바카라 커뮤니티 (AIST)가 주도하고 있으며 현재 "Black Koji Fungus Genome Analysis 컨소시엄 컨소시엄 (Black Koji Fungus Genome Analysis 컨소시엄)과 함께 일하고 있으며, 이는 Advanced Industrial and Technology (AIST) 국립 연구소가 이끄는"Black Koji Fungus Genome Analysis 컨소시엄 "과 함께 일하고 있습니다 컨소시엄, "국립 주류 연구소, 대학교, 술 양조장, 오키나와 현 관련 기관 및 기타 조직을 포함합니다Aspergillus awamori: Aspergillus awamori의 전체 바카라 족보의 뉴클레오티드 초안을 세계 최초의 성공적인 해독 (바카라 족보 개요 분석)

이번에 수행 된 Black Koji Mold의 바카라 족보 분석은 전통적으로 오키나와에서 Awamori 생산에 사용되었으며 Shochu 생산에 널리 사용됩니다 (Aspergillus kawachii8701_8775

Nite, AIST 및 기타 사람들은 이전에 Sake, Miso, 간장 소스 등의 생산에 사용 된 Yellow Koji Mold (Aspergillus oryzae: Aspergillus oryzae)의 게놈 분석이 수행되었고 2005 년 12 월 22 일에 분석이 발표되었습니다 검은 바카라 족보의 게놈 분석은 전통적인 일본 산업용 소멸의 대표적인 박테리아 종의 게놈에 대한 완전한 정보를 제공 할 것입니다

검은 색 코지 몰륨 NBRC 균주 사진 4314
NBRC 스트레인 4314 (사진 : Nite-NBRC OKANE)


Koji Mold Photo
Kojimolium (Yellow Kojimolium)
(Sake, MISO, 간장)
Black Kojimolium Ceramics의 사진
Black Kojimpanum
(Awamori, Shochu)
흰색 바카라 족보 사진
White Kojimpanum
(Shochu)

Koji Mold 제품군은 포자의 색상에 따라 세 가지 유형으로 나뉘어 있으며 의도 된 용도에 따라 사용할 수 있습니다 단순히 바카라 족보라고 말하면 종종 노란색 바카라 족보 (알코올 연구소의 사진 제공)를 나타냅니다



사회적 배경

바카라 족보의 구성원은 쌀, 밀 및 감자와 같은 전분을 설탕으로 전환하고 효모를 알코올로 전환하여 알코올을 양조합니다 바카라 족보 (노란색 바카라 족보)는 혼슈에서 술, 된장, 간장 등을 생산하는 데 사용되었습니다 한편, 오키나와 및 쿠슈와 같은 고온에서 알코올 양조의 경우, 검은 바카라 족보는 시트르산과 같은 유기산을 사용하여 기타 박테리아의 성장을 억제 할 수있는 능력이 높고, 변형 된 흰색 바카라 족보는 전통적으로 사용되었습니다 전통적으로 음식에 사용 되었기 때문에 안전은 서방 국가에서 널리 인정됩니다

Koji Mold와 그 부재는 유용한 효소와 구연산과 같은 유기물을 생산하기 때문에 양조 이외의 다양한 목적으로 사용되었습니다 예를 들어, 20 세기 초 타카민 호키치 박사가 실질적으로 사용하는 타카 디 아스타 제는 여전히 위장 의약품의 성분으로 널리 사용됩니다 또한 Koji Mold Group은 현대 생명 공학 산업에서 널리 사용됩니다 특히, 전통적으로 사용되었고 안전한 것으로 인식되어 왔기 때문에, 식품 가공에 사용되는 다양한 효소와 기능성 식품 생산을 포함하여 일상 생활과 밀접하게 연결된 장소에서 널리 사용됩니다 유전자의 전체 범위는 바카라 족보 분석을 통해 밝혀 질 수 있으며, 유전자 공학 기술을 사용한 유용한 단백질의 생산 및 높은 중합체 분해 활성을 사용하는 바이오 매스 분야에서의 사용을 포함하여 더 넓은 범위의 산업에서 사용될 것으로 예상된다

최근

Black Koji Mold는 Ryukyu에 고유 한 것으로 생각되며, Shuri 지역에서 분리되어 출판 된 후 1901 년 이누키 타마키에 의해 첫 번째 학술 연구가 발표되었다고합니다 그 이후로, 그 사용이 쿠슈 지역으로 확장되었지만, 다양한 지역에서 분리 된 균주는 국내 미생물 보존 기관에서 유지되었습니다

이번에 분석 된 NBRC 균주 4314 (= RIB 2604 변형)도 70 년 전에 분리되었습니다 현재 NITE의 생물학적 유전자 자원 부 (NBRC)와 LIB (Liquor Research Institute)에 의해 유지되고 있습니다

Black Koji Mold의 분류는 유전자 염기 서열을 기반으로 한 최근 분석을 기반으로하며 시트르 산 발효 등을 위해 산업용으로 사용됩니다블랙 바카라 족보(Aspergillus Niger)와 밀접하게 관련된 그룹과 검은 바카라 족보가 주류 인 다른 그룹 인 그룹으로 크게 나눌 수있는 것으로 밝혀졌습니다 NBRC 4314 균주는 후자 그룹에서 표준 균주로 간주됩니다 그것은 흰색 바카라 족보와 매우 밀접한 관계를 맺고있는 것으로 생각되며, 그 기원은 그 기원에서 발견 된 것으로 여겨진다 NBRC 4314의 매우 정확한 초안 시퀀스를 해독함으로써, 표준 게놈 정보는 일본의 대표적인 산업용 미생물 인 Koji Mold의 두 가지 대표 종에 대해 준비되었습니다

분석 요약 및 예상 효과

분석 된 NBRC 균주 4314의 바카라 족보 크기는 약 3 천 5 백만 기본 쌍으로 추정되었고, 염색체 말단을 제외한 바카라 족보의 99% 이상에 대해 매우 정확한 염기 서열이 얻어졌다

NITE는 게놈 서열 데이터의 완료를 계속 분석하고 개선 할 것이며, 게놈의 검은 바카라 족보마 게놈 분석 컨소시엄 아래에서도Anotation, 기타Aspergillus filamentous 바카라 족보와 바카라 족보 비교를 수행 할 계획입니다

이것은 노란색 바카라 족보 및 기타 필라멘트 곰팡이와는 다른 새로운 탄수화물 분해 효소, 단백질 분해 효소, 지질 분해 효소 등의 발견으로 이어질 것으로 예상된다 높은 안전성으로 유기산 및 기능성 다당류와 같은 유용한 물질의 생산, 바이오 매스의 효과적인 사용을 포함하여 다양한 생명 공학 분야에서 사용될 것으로 예상됩니다

또한, 오키나와 현은 새로운 세대 시퀀싱 장치입니다Giga 시퀀서2008 년 8 월 18 일 발표)와의 긴밀한 협력으로 수행 될 것이며, 오키나와 현이 소유 한 개별 균주를 식별하고 기능과 안전을 평가하는 표준으로 사용되는 고정밀 데이터를 제공함으로써 오키나와 현으로부터의 Awamori의 품질을 향상시키는 데 기여할 것으로 예상됩니다

오키나와 현 프로젝트 및 기타와의 협력

이번에는 우리는Sanger Method에 의해 얻어졌다 이 방법은 인간 바카라 족보 분석을 포함하여 대부분의 바카라 족보 분석을위한 표준 방법으로 사용되었으며, 매우 신뢰할 수있는 서열 데이터 (원래 데이터의 경우 99% 이상, 결합 및 조직 상태의 경우 9999-999999% 이상)를 얻을 수 있다는 사실을 특징으로합니다 상세한 분석은 염색체 말단과 같은 특수 영역을 제외하고 거의 전체 바카라 족보에 대한 참조로 사용되는 고정밀 기본 서열 데이터를 초래할 것이다

한편, 오키나와 현은 작년에 소개 된 Giga 시퀀서라는 최신 분석 장비를 사용할 계획입니다 이 방법의 길이는 짧은 길이가 25-35베이스 (Sanger 방법의 약 800베이스)를 가지지 만, 단위 시간당 데이터 생산은 병렬 처리 (Sanger 방법의 길이의 100 배 이상)로 인해 매우 높습니다 이를 통해 짧은 시간 내에 실용 균주를 포함한 다수의 균주에 대한 바카라 족보 데이터를 얻을 수 있습니다

GigaseQuencer와 함께 얻은 서열을 정확하게 결합하고 구성하는 것이 어려우므로 Okinawa Prefecture Project에서 얻은 NBRC 4314 균주의 서열은 참조 데이터로서 중요한 역할을 할 것입니다 즉, 기본 서열 (돌연변이)의 차이는 GigaseQuencer에 의해 얻은 개별 서열 데이터를 참조 데이터 (아래 다이어그램 참조)를 비교하여 각 균주의 유전자형, 기능성, 안전성 등을 평가할 수있게함으로써 식별 될 수있다

우리는 또한 다른 대학 및 연구 기관과의 협력을 구축하고 얻은 서열 정보를 효과적으로 활용하는 것을 목표로합니다

오키나와 현 프로젝트 및 기타 프로젝트와의 협력 다이어그램

검은 색 바카라 족보 말류 게놈 분석 컨소시엄

Nite와 공동 연구를 수행하는 "Black Koji Mold Genome Analysis Consortium"은 AIST가 이끄는 다음 기관으로 구성됩니다 기관은 바카라 족보 (유전자 예측 및 주석)에 주석을 달기 위해 함께 노력합니다Aspergillus kawachii(Aspergillus kawachi)의 랜덤 시퀀스를 사용한 시퀀스 획득,Aspergillus Niger(Aspergillus nigger)Aspergillus kawachii계획되어 있습니다

독립 관리 회사 고대 산업 과학 기술 연구소 (대표) 알코올 연구소
대학 Kinki University Kanazawa Institute of Technology
  Waseda University Tohoku University
  도쿄 대학  
오키나와 현 및 관련 기업 오키나와 현 산업 기술 센터 열대 테크노 센터
기타 Asahi Brewery Co, Ltd 일본 양조 협회


터미널 설명

◆ 바카라 족보
종이 소유하는 모든 유전자 세트 유전자는 DNA로 구성되며, 4 가지 물질 중 하나가 A, T, G 및 C로 약칭 된 물질 인 DNA로 구성되며, 단백질의 합성 및 이들이 사용되는 방법은 이들 4 가지 물질의 서열 (서열)에 의해 암호화된다 바카라 족보의 게놈은 총 3 억 5 천 5 백만 단위로 구성됩니다[참조로 돌아 가기]
◆ Kojimpanicum
일본의 양조 및 식품에 일반적으로 사용되는 미생물, 노란색 바카라 족보 (Aspergillus oryzae와 같은 Orise 그룹), 검은 바카라 족보 (Pergillus oryzae와 같은 Orise Group) 및 White Koji Mold (Orise Group) 및 Aspergillus oryzi oryzi gollus oryzi 곰팡이 (Orise Group) 및 White Koji Mold (Orise Group) 및 White Koji Mold (Orise Group) 및 White Koji Mold로 구성됩니다 Aspergillus oryzae와 같은 그룹)[참조로 돌아 가기]
◆ Biomass
가축 폐기물, 음식물 쓰레기 및 목재 폐기물과 같은 동물과 식물에서 태어난 재생 가능한 유기 자원 (농업, 임업 및 어업부, 바이오 매스 Nippon 웹 사이트)[참조로 돌아 가기]
◆ Black Mold
일반적으로 Aspergillus nigger로 알려져 있습니다 식민지가 자라면서 검은 색으로 보입니다[참조로 돌아 가기]
◆ anotation
주석은 어떤 부분이 어떤 역할을하는지 (예 : 어떤 단백질 합성이 수행되는지)를 나타내는 DNA의 A, T, G 및 C로 축약 된 4 가지 유형의 물질에 주석을 달 수있는 과정입니다[참조로 돌아 가기]
◆ Aspergillus filamentous 바카라 족보
미생물 인 바카라 족보 유형 이름은 포자의 모양이 가톨릭 성수 뿌린 도구 (Aspergirum)와 비슷하기 때문에 주어졌습니다 그것은 발효에 사용되는 것부터 식물과 동물을 감염시키는 것까지 다양한 특성을 가진 종으로 구성됩니다[참조로 돌아 가기]
◆ Giga 시퀀서
2 세대 DNA 시퀀서 기존의 DNA 시퀀서와 달리, 뉴클레오티드 서열은 한 번에 판독 될 수 있지만 (Sanger 방법의 약 800 염기) 25-35 염기에서 짧아 질 수 있지만, 병렬 처리로 인해 단위 시간당 데이터 생성은 매우 높습니다 (Sanger 방법의 크기의 100 배 이상)[참조로 돌아 가기]
◆ Sanger Method
기존 DNA 시퀀서를 사용한 DNA의 서열 분석 방법 서열은 샘플 DNA를 주형으로 사용하여 효소를 사용하여 DNA를 합성 할 때 사용되는 물질의 유형 (A, T, G 및 C)의 유형을 결정함으로써 분석된다[참조로 돌아 가기]


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