게시 및 게시 날짜 : 2008/11/24

인간 바카라 주소 발현을위한 세계 최대의 클론, 게놈 이후 연구 지원,

이 연구 결과의 요점

  • 세계 최대 인간, 약 15,000 종, 약 22,000 명의 인간 유전자의 약 70%게이트웨이®우리는 11 월 24 일부터 입력 클론 정보 데이터베이스를 만들고 클론을 제공하기 시작합니다
  • 건설 된 클론은 밀 생식기 추출물로 표현되어 효소 활동 등을 유지하는 것으로 확인 된 매우 고품질 자원입니다
  • Human게이트웨이®진입 클론은 포괄적 인 바카라 주소 (인간 바카라 주소 공장)의 효율적인 생산에 사용되며, 바카라 주소 상호 작용 및 IPS 연구와 같은 게놈 후 연구에 널리 사용되는 매우 중요한 연구 자원입니다
참고)게이트웨이®isInvitrogen회사의 등록 상표

NEDO 기술 개발 기관은 AIST, JBIC, NITE 등과 함께 약 15,000 종에 해당하며, 이는 총 인간 유전자의 약 22,000 개로 알려져 있으며, 이는 약 22,000 명이라고합니다게이트웨이®진입 클론1)우리는 세계 최대의 고품질 바카라 주소 발현 자원을 구축했으며 연구원과 다른 사람들에게 제공하기 시작했습니다

이 연구 결과에 대한 자세한 내용은자연Group Science Journal자연 방법12 월호에 게시 됨 (DOI : 101038/nmeth1273, 디지털 버전은 11 월 24 일 오전 3시에 출시 될 예정입니다)


1 연구 개요 및 역사

NEDO (New Energy and Industrial Information)와 협력하여 생물 지수 정보 컨소시엄 (JBIC)과 계약을 맺고 2000 년부터 2005 년까지 "바카라 주소 기능 분석 프로젝트"및 "바카라 주소 기능 분석 프로젝트"및 "바카라 주소 기능 분석 프로젝트"및 "바카라 주소 기능 분석 및 활용 프로젝트"를 수행하고 있으며, National Institure Foundation Organization (NITE) 및 개인 회사와 협력했습니다

이 프로젝트는 세계 최고의 국가 인 Nedo 's "전장 cDNA2)구조 분석 프로젝트 (FLJ CDNA 프로젝트)3)"의 결과를 기반으로합니다 그것은 바카라 주소 기능 분석 분야에서 이점을 유지하기 위해 구현 되었으며이 프로젝트의 일환으로 세계 최대의 인간입니다게이트웨이®우리는 진입 클론을 준비하기 위해 노력하고 있습니다

지금까지의 결과에 기초하여, 인간은 약 15,000 종에 해당하며, 이는 약 22,000 명 또는 모든 인간 유전자의 약 70%라고합니다게이트웨이®우리는 입구 클론을 만들고 세계 최대의 바카라 주소 발현 자원을 구축했습니다 이 자원은 밀 세포가없는 바카라 주소 합성 시스템을 사용하여 합성 가능한 것으로 확인 된 매우 고품질 자원이며, 효소 활성 등을 통해 그 기능을 유지하는 것으로 확인되었습니다

이 자원은 Nite Biotechnology 본부의 NBRC (Nixological Genetic Resources Division)에서 11 월 24 일에 판매하려는 연구원 및 기타 연구원 등으로 분포 할 것입니다 또한 인간게이트웨이®인간 유전자/바카라 주소 데이터베이스는 진입 클론에 대한 정보를 볼 수 있습니다 (인간 유전자 및 바카라 주소 데이터베이스, hgpd :http : //wwwhgpdjp/또는http : //hgpdlifesciencedbjp/)도 동시에 출시되었습니다

이 클론을 사용함으로써, 유전자 생성물 인 바카라 주소의 쉽고 높은 처리량 생산에서 가능합니다 그것은 게놈 이후 연구를 지원하는 중요한 생물 소스이며, 우리는 다양한 분야에서 그것을 사용함으로써 알려지지 않은 기능성 바카라 주소 및 약물 발견 연구의 분석을 촉진하기를 희망합니다

2 연구 내용

Human게이트웨이®진입 클론은 21,485 인간 cdnas입니다ORF 지역4)PCR으로 증폭게이트웨이®PDONR201 공여자 벡터와 재결합 한, 우리는 총 33,275 N- 유형 (ORF의 끝에서 번역 종단 신호와 20,521 F- 타입 (동일한 위치에서 번역 종결 신호가없고 C- 말단에 태그가 없음)을 만들었습니다http : //wwwhgpdjp게이트웨이®진입 클론게이트웨이®식 벡터 (대상 벡터) 및 Human게이트웨이®발현 클론이 생성되고 바카라 주소 합성 이이 클론에 따라 수행됩니다 개선 된 실험 시스템과 인간게이트웨이®발현 된 클론의 바카라 주소 합성에 필요한 부분 만 PCR에 의해 DNA를 증폭하여 시험 관내 mRNA 합성을위한 템플릿으로서 작용 하였다 PCR에 의해 제조 된 DNA 단편을 주형으로 사용하여, mRNA를 합성 한 다음 사용한다밀 생식기 추출물5)와 혼합하여 바카라 주소이 합성된다 DNA 재조합으로부터 바카라 주소 합성으로의 모든 과정의 시험 관내 합성에 의해, 간단하고 격동적인 방식으로 포괄적 인 인간 바카라 주소을 합성 할 수있게되었다 따라서 13,364 명게이트웨이®우리가 진입 클론에서 바카라 주소을 합성하고 합성의 효율을 조사하려고 할 때, 우리는 다양한 정도에 따라 모든 바카라 주소이 기본적으로 합성되었다는 것을 발견했습니다 그리고 거의 모든 경우에가용성 분수6)에서 확인되었으며 밀 생식기 발현 시스템이 우수한 시스템임을 재확인했습니다 포스파타제와 사이토 카인을 예로 사용하여 밀 생식기 추출물에서 생산 된 바카라 주소이 활성임을 확인했습니다 또한, 인간 바카라 주소의 포괄적 인 발현의 예로서, 13,277 개의 바카라 주소을 발현시키고 유리 슬라이드에서 합성 바카라 주소을 발견하여 바카라 주소 칩을 생성 하였다티로신 키나제7)의 활성을 측정함으로써 입증되었다 이 연구는 종합적으로 시험 관내에서 합성 된 전체 바카라 주소에 중점을 둡니다시험관 내 프로테옴 연구8)"및 앞으로Proteomics9)우리는 이것을 새로운 연구 접근법으로 홍보하고 싶습니다

이 사람들게이트웨이®진입 복제는 현재 NEDO 프로젝트에서 "화합물 등을 사용한 생물학적 시스템 제어 기본 기술 개발 (2006-2000)"(2006-2000)에 사용되고 있으며, 기본 연구에서 바카라 주소 상호 작용 연구, 약물 발견으로 이어지는 화합물 스크리닝 및 IPS 연구에 이르기까지 널리 사용됩니다

Human게이트웨이®진입 클론, 발현 바카라 주소에 대한 정보 및 클론을 얻는 정보에 대한 자세한 정보는 인간 유전자 및 바카라 주소 데이터베이스 (인간 유전자 및 바카라 주소 데이터베이스, hgpd :http : //wwwhgpdjp/또는http : //hgpdlifesciencedbjp/)에 게시

3 클론을 얻는 방법

이번에 창조 된 인간게이트웨이®Entry Clones는 제품 평가 기술 인프라 조직 (NITE) 인 Biognetic Resources Division (NBRC)에서 구입할 수 있습니다 가격은 대학, 교육 기관 및 국가 및 공공 시험 연구 기관의 15,750 엔 (세금 포함)이며 개인 시험 연구 기관의 경우 31,500 엔 (세금 포함)입니다 자세한 내용은 홈페이지 (http : //wwwnbrcnitegojp/hgentryhtml) 제발


용어집

1) 인간게이트웨이®진입 클론
게이트웨이®일반 목적 발현 시스템은 제한 효소 또는 DNA 리가 제없이 시험 관내 대장균 Genomic DNA 및 Lambda Phage DNA의 부위 특이 적 재조합 반응을 사용하는 DNA 재조합 기술입니다 사람들게이트웨이®발현 클론은 입력 클론과 발현 벡터 (대상 벡터) 사이의 사이트 별 재조합에 의해 쉽게 생성 될 수 있습니다 사람들게이트웨이®진입 클론은 바카라 주소 인코딩 ORF의 양쪽 끝에 첨가 된이 부위-특이 적 재조합 서열을 갖는 클론이며, 바카라 주소 합성을위한 중심 바카라 주소 발현 자원이다
(http : //wwwinvitrogencojp/게이트웨이/indexshtml)
참고)게이트웨이®iInvitrogen회사가 등록한 상표[참조로 돌아 가기]
2) 전장 cDNA
cDNA는 게놈 DNA로부터 불필요한 서열을 제거하고 바카라 주소을 암호화하는 서열로 구성된 유전자 정보 물질 인 mRNA (Messenger RNA)를 사용하여 제작 된 DNA이다 단편화 된 CDNA와 달리, 전장 CDNA는 전장 바카라 주소을 합성하기위한 설계 정보를 포함하므로, 따라서 전장 바카라 주소을 합성 할 수있다 따라서, 게놈 후 연구는 바카라 주소 합성에 매우 중요한 자원이다 이 전장 cDNA를 효율적으로 합성하기 위해서는 매우 높은 기술이 필요하며 일본이 세계보다 앞서있는 지역입니다[참조로 돌아 가기]
3) FLJ CDNA 프로젝트
이것은 일본의 자랑스러운 "전장 cDNA 구조 분석 프로젝트"입니다 FLJ는전장 및 긴 일본에 대한 약어입니다[참조로 돌아 가기]
4) ORF 지역
바카라 주소을 암호화하는 유전자의 DNA 영역 ORF는오픈 리딩 프레임에 대한 약어입니다[참조로 돌아 가기]
5) 밀 생식기 추출물
연삭 밀 생식기로부터 얻은 바카라 주소 합성 추출물 이 추출물에 기초하여 세포가없는 바카라 주소 합성 시스템이 생성되었다 그것은 수십 년 동안 바카라 주소 합성에 사용되어 왔지만 Ehime University의 Endo 교수의 기술적 개선으로 바카라 주소 합성 능력이 크게 향상되었습니다[참조로 돌아 가기]
6) 가용성 분수
수용성 바카라 주소이 물에 용해되는 분획 일반적 으로이 분획에 들어오는 바카라 주소은 제대로 접고 활성화 될 가능성이 있다고 생각됩니다[참조로 돌아 가기]
7) 티로신 키나제
티로신 키나제는 종종 자신의 티로신 잔기를 인산화합니다 밀 생식기 추출물에는 티로신 키나제가 없기 때문에 밀 생식기 추출물에서 발현 된 인간의 티로신 키나제 활성을 쉽게 측정 할 수 있습니다[참조로 돌아 가기]
8) in vitro proteome 연구
현재까지 프로테옴 연구는 특정 조직 또는 기관에 포함 된 바카라 주소 그룹을 추출하고 분석하는 전통적인 연구이며, 생체 내 (생체 내) 프로테옴 연구라고 불릴 수 있습니다 우리는 시험관에서 바카라 주소을 종합적으로 합성하고이를 사용한 연구는 시험 관내 (시험 관내) 프로테옴 연구에서 호출된다고 제안한다[참조로 돌아 가기]
9) Proteomics
개별 바카라 주소의 전통적인 분석과 달리 Proteomics는 바카라 주소과 바카라 주소 데이터를 표현하고 수집하고 분석하는 바카라 주소을 체계적이고 포괄적으로 분석하는 기술과 방법론을 말합니다 그것은 모든 유전자 (게놈)를 분석하는 유전체학에 반응하여 모든 바카라 주소 (프로테옴)을 분석하기 때문에 프로테오믹스라고합니다 바카라 주소체를 분석하기위한 전형적인 방법은 질량 분석기를 사용하여 높은 감도 및 높은 처리량을 갖는 세포 내에서 작동하는 바카라 주소을 식별하고 정량화하는 기술이다 이 분야는 노벨상을 수상한 타나카 코이치 (Tanaka Koichi)로 급격히 발전했으며, 바카라 주소과 같은 불안정한 바이오 폴리머가 대량 분석을 가능하게하기 위해 빠르게 발전했습니다[참조로 돌아 가기]


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