게시 및 게시 날짜 : 2008/12/18

바카라 하는 법 2 차 구조를 예측하기 위해 최고 정밀 소프트웨어 개발

- 바카라 하는 법 약물 개발, 새로운 기능성 바카라 하는 법- 발견을위한 도구

포인트

  • 바카라 하는 법 2 차 구조 예측으로 세계에서 가장 높은 정확도를 달성
  • 기능적 바카라 하는 법 발견 및 기능 분석의 효율성에 기여할 것으로 예상
  • 생물 지적 및 바카라 하는 법 약물 개발 도구로 전 세계적으로 사용될 것으로 예상

요약

바카라 커뮤니티 [Yoshikawa Hiroyuki 회장] (이하 "AIST")생명 및 정보 공학 연구 센터Mitsuyama Osamu의 연구팀, 바카라 하는 법 정보 공학 팀 책임자, Kitada Naotaka, AIST의 특별 연구 연구원, Mizuho Information Research Fellow, Co, Ltd, Ohara Yukio의 사장 겸 CEO] (Mizuho Information Fellow로 언급) Naoyuki] (이하 "JBIC"이라고 함), Sato Kengo, 연구원 및 도쿄 대학 [Komiya Hiroshi 회장 겸 회장] (이하 "도쿄 대학"이라고 함)은 공동 연구팀이 유전자 발현을 통제하는 데 중요한 역할을했습니다바카라 하는 법Centroidfold"개발되었습니다

바카라 하는 법는 오랫동안 유전자 DNA로부터 단백질이 합성 될 때 상호 작용자로서 역할을하는 것으로 오랫동안 알려져 왔지만, 최근에는 그러한 역할을하지 않는 바카라 하는 법가 유전자 발현 제어 및 세포 발암에 중요한 역할을한다는 것이 발견되었다 그런 바카라 하는 법기능성 바카라 하는 법, 그러나 기능을 표현하기 위해 길고 단일 가닥 바카라 하는 법 분자는 부분적으로 이중 가닥을 형성하여 2 차 구조라는 특정 구조를 생성합니다

이번에 개발 된 바카라 하는 법 2 차 구조 예측 방법은예상 예측 정확도가장 큰 것은 벤치 마크 테스트가 세계에서 가장 높은 정확도로 2 차 구조를 예측할 수 있음을 보여줍니다그랬습니다 그것은 기능적 RNA의 발견과 미래의 기능의 설명에 기여할 것으로 기대됩니다 "Centroidfold"는 무료 소프트웨어로 무료로 제공됩니다

이 연구는 가까운 시일 내에 영국 신문이 될 것임을 주목하십시오Bioinformatics잡지에 출판 될 예정입니다

바카라 하는 법 2 차 구조 예측 방법의 개요 다이어그램

개발의 사회적 배경

이전에, 바카라 하는 법는 DNA 서열에 기초한 단백질을 합성하기위한 중간 물질로 간주되었지만, 최근 몇 년 동안 바카라 하는 법는 신체에서 다양한 기능을 수행하고 삶의 기능을 밝히기위한 중요한 물질로 위치한 것으로 밝혀졌다 이러한 바카라 하는 법를 기능적 바카라 하는 법라고하지만 기능성 바카라 하는 법를 사용하는 약물도 개발되고 있습니다

바카라 하는 법는 길고 단일 가닥 분자 인 바카라 하는 법 분자가 부분적으로 이중 가닥을 형성하여 특정 구조를 형성 할 때 기능을 발현한다 이중 가닥은 바카라 하는 법, A 및 U 및 G를 구성하는 4 개의 염기 (A, G, C, U)로 인해 형성됩니다 단일 가닥 바카라 하는 법에서 염기 쌍의 형성을 2 차 구조라고한다 (3 차원 구조를 3 차 구조라고도합니다)

바카라 하는 법의 2 차 구조 이해는 바카라 하는 법의 기능을 설명하는 데 중요한 단서를 제공합니다 그러나, 2 차 구조 실험에서의 관찰은 노력과 비용 측면에서 현실적이지 않으며, 컴퓨터 기반 2 차 구조 예측은 바카라 하는 법 연구에서 중요한 도구가되었다

2 차 구조 예측 기술은 DNA 증폭에 필수적입니다 (PCR)에서 사용할 프라이머 설계 및 최근 몇 년 동안 제약으로 응용 프로그램을 개발하고 있습니다바카라 하는 법 간섭si바카라 하는 법의 설계를 포함하여 생명 공학 산업에 큰 영향을 미치는 기본 기술입니다 그리고 마이크로 어레이에 사용되는 프로브 설계

보다 정확한 2 차 구조 예측은 더 높은 정확도로 si바카라 하는 법를 설계하고 생체 내 바카라 하는 법 분자의 기능의 설명을 추정하는 등 바카라 하는 법 약물 개발을위한 ART의 수준을 더욱 높일 것입니다

연구 이력

향후 게놈 약물 발견을 지원하기위한 기본 기술 구성의 일환으로 AIST는 기능적 바카라 하는 법의 포괄적 인 예측에 대한 연구를 진행하고 있습니다 이를 위해 우리는 Mizuho Information Research Institute, JBIC 및 University와 협력하여 2 차 구조를 효율적으로 처리하는 기본 기술을 개발하여 컴퓨터에서 바카라 하는 법의 기능을 설명하는 데 필수적입니다 이번에는 바카라 하는 법 2 차 구조 예측에 대한 새로운 이론을 기반으로 세계에서 가장 높은 예측 정확도를 가지고 있습니다Centroidfold"개발되었습니다

이 연구는 NEDO (New Energy Technology Development Organization)의 "기능적 바카라 하는 법 프로젝트"에 의해 수행되었습니다

연구 컨텐츠

하나의 긴 바카라 하는 법 스트랜드는 수많은 기본 쌍 (a 및 u, g 및 c)을 가져 가지만 바카라 하는 법를 안정적으로 만드는 기본 쌍의 수는 제한적이며 단일 숫자는 없습니다 전통적인 예측에서,이 방법은 가장 안정적인 2 차 구조를 올바른 보조 구조로 찾는 데 사용되었지만, 가장 안정적인 2 차 구조가 반드시 올바른 2 차 구조가 아는 경우가 많다는 것을 경험적으로 발견했습니다

세포 내의 물질은 단일 구조에 고정되어 있지 않지만 열 에너지로 인해 모양을 바꾸면서 끊임없이 흔들리고 있으며 바카라 하는 법도 흔들리는 것으로 생각됩니다 기존의 2 차 구조 예측에는 2 차 구조가 가장 안정적이라는 이론이더라도 변동에 취약한 구조가 포함됩니다 최근의 연구에 따르면 이것이 전통적인 예측 방법이 올바른 2 차 구조를 예측할 수없는 이유입니다

위의 결과에서 영감을 얻은 협업 연구팀은 예측 정확도의 예상 값을 극대화하기 위해 고유 한 방법을 사용하여 변동에 덜 민감한 2 차 구조 예측 기술을 성공적으로 개발하고 "Centroidfold"

"중심"개요 다이어그램

 「Centroidfold"바카라 하는 법 2 차 구조 예측의 정확성을 평가하는 데 널리 사용되는 벤치 마크 데이터 세트 (구조가 알려진 바카라 하는 법)를 사용한 컴퓨터 예측 실험에 의해 기존의 바카라 하는 법 2 차 구조 예측 방법보다 더 높은 것으로 입증되었습니다

 「Centroidfold""무료 소프트웨어로 무료로 제공되며 2 차 구조 예측 서비스는 12 월 18 일부터 인터넷을 통해 출시됩니다 (http : //wwwnc바카라 하는 법org

미래 계획

 「Centroidfold" 생물학에서 바카라 하는 법의 기능을 명확히하고 새로운 기능적 바카라 하는 법를 발견하는 데 도움이되는 동시에 고품질 PCR 프라이머, si바카라 하는 법 및 마이크로 어레이 프로브 설계를위한 생명 공학 산업에 도움이 될 것으로 예상됩니다


터미널 설명

◆ 바카라 하는 법
리보 핵산에 대한 약어 그것은 삶의 활동에 필수적인 물질이며 유전자 정보를 읽는 데 중요한 역할을합니다 유전자 정보는 단백질을 합성하기 위해 DNA에서 바카라 하는 법로 복사되므로 바카라 하는 법는 중간체로 간주되었습니다[참조로 돌아 가기]
◆ 기능성 바카라 하는 법
는 신체에서 활성화되고 단백질로 번역되지 않고 전사/번역 제어와 같은 기능을 갖는 모든 바카라 하는 법를 말합니다 기능적 바카라 하는 법의 기능과 2 차 구조 (및 3 차원 구조) 사이에 종종 관계가있는 것으로 알려져있다[참조로 돌아 가기]
◆ 예측 정확도에 대한 예상 값
바카라 하는 법의 2 차 구조의 에너지가 낮을수록 그 구조를 취할 가능성이 높습니다 2 차 구조 예측의 정확도를 예측할 확률은 각 2 차 구조에 대해 열역학적으로 계산 된 구조의 용이성 (확률)으로부터 얻을 수있다[참조로 돌아 가기]
◆ PCR
세포 추출물과 같은 샘플에 함유 된 특정 DNA를 증폭시키는 널리 사용되는 실험 방법 표적 DNA는 특정 염기 서열을 갖는 프라이머라고 불리는 소분자의 DNA 서열에 의해 선택된다 프라이머는 구체적으로 표적 DNA에 결합하는 서열이어야한다 표적 DNA (바카라 하는 법)의 2 차 구조는 프라이머 설계에서 고려 될 수 있으며, 이차 구조를 형성 할 수있는 표적 DNA (바카라 하는 법)가 정상적인 PCR 반응을 방해 할 수 있기 때문이다[참조로 돌아 가기]
◆ 바카라 하는 법 간섭 (바카라 하는 법간섭: 바카라 하는 법i)
A phenomenon in which si바카라 하는 법 is introduced into a cell degrades messenger 바카라 하는 법 (m바카라 하는 법) with complementary base sequences, and gene expression is suppressed 지금까지 치료하기 어려운 암, 유전 질환 및 전염병을 포함한 다양한 질병의 치료를 가능하게하는 약물 개발 기술이 될 것으로 예상됩니다[참조로 돌아 가기]
◆ si바카라 하는 법 (작은 간섭바카라 하는 법)
바카라 하는 법 간섭에서 표적 유전자의 m바카라 하는 법에 상보 적으로 결합하는 약 20 내지 22 염기의 짧은 바카라 하는 법 분자 m바카라 하는 법에 대한 si바카라 하는 법의 상보 적 결합은 유전자 발현을 억제하는 m바카라 하는 법의 번역을 억제한다 표적 m바카라 하는 법 서열이 2 차 구조를 형성 할 수 있다면, si바카라 하는 법는 효과적이지 않을 수있다 따라서, si바카라 하는 법 설계는 표적 m바카라 하는 법의 2 차 구조를 고려할 수있다[참조로 돌아 가기]

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