게시 및 게시 날짜 : 2018/05/17

로투스 바카라자 기능 결핍이 매우 빈번하고 지나치게 상속 된 것을 감지했습니다

발표 사진

  • 로투스 바카라자 기능적 결핍이 종종 그 경우정치적 상속(참고 1) 경우라고 생각되었지만 신진 효모에서 온 것입니다필수 로투스 바카라자(주 2) 누락 된 균주Cell Morphology(주 3)) 포괄적으로 조사되었고 필수 로투스 바카라자의 약 60%의 기능적 결함이 역전됩니다극단 상속(주 4)가 공개되었습니다 기능적 부족 돌연변이는 기능이 있습니다대립 로투스 바카라자(참고 5)는이를 보상하지 않으므로 헌법이 반드시 하위 유형보다 우수하지는 않습니다
  • 각 셀형태 학적 표현형(주 6)의 정량 분석은 많은 로투스 바카라자의 기능적 결함이 명백하다는 것을 보여 주었다
  • 이종 접합 유형(주 7)로투스 바카라자 결핍 균주(주 8) 표시된 표현형은 로투스 바카라자 기능과 밀접한 관련이 있음을 밝혀 냈습니다
  • 이 발견은 복잡한 생물학적 시스템을 분석하고, 질병 로투스 바카라자를 진단하며, 약물 표적을 탐색하는 데 도움이 될 것으로 예상됩니다


게시 요약

이종 접합 유형은 이종 접합이라고도하며, 로투스 바카라자좌에 AA와 같은 다른 대립 로투스 바카라자가있는 이배체 유기체의 상태를 나타냅니다 A가 기능적 대립 로투스 바카라자이고 A가 기능적 돌연변이 인 경우, 돌연변이 (A)는 기능적 대립 로투스 바카라자 (A)에 의해 보충되고 기능성 결핍의 표현형은 (명백한 상속이 아님) 나타나지 않을 것으로 예상된다 그럼에도 불구하고, 로투스 바카라 적 결함의 현상은Haplo-Fulfillment(주 9)로 알려져 있으며 뛰어난 로투스 바카라자 현상으로 간주되었습니다 (그림 1)

Onuki Shinsuke의 연구 그룹 인 Onuki Shinsuke의 연구 그룹, 도쿄 대학의 대학원 제작 과학 대학원과 Oya Teiichi 교수 (AIST의 AIST 및 개방형 혁신 실험실의 연구원, Tokyo University of Tokyo University)의 Oya Teiichi 교수 (AIST 및 개방형 혁신 실험실의 연구원)의 일부) 진핵 생물에 대한 모델로 알려진 신진 효모에서 필수 로투스 바카라자의 이형 접합 돌연변이 체는 일배일 부족이 결코 예외적 인 로투스 바카라 적 현상이라는 것을 발견했다 Saccharomyces 효모는 1,112 개의 필수 로투스 바카라자를 가지지 만, 모든 필수 로투스 바카라자의 누락 된 돌연변이 체의 59% (657 로투스 바카라자)는 야생형 균주와 다른 세포 형태를 나타내 었으며, 이는 일배 체압을 나타냅니다 (그림 2) 다시 말해, 필수 로투스 바카라자의 거의 60%가 명백히 상속되었습니다

기존의 지혜와 달리, 로투스 바카라자의 기능적 결함이 자주 상속된다는 큰 의미가있다 예를 들어, 질병 로투스 바카라자의 하나의 사본을 가진 운반체에서도 독특한 표현형의 출현은 질병 로투스 바카라자가 발생하기 전에 질병을 예방하기 전에 이해하게 만들 수 있습니다 또한, 기능적 대립 로투스 바카라자에 의해 보상되는 것으로 생각 된 기능적 결핍 돌연변이로서 Overt와 Sublim 사이의 우수성과 열등 성의 개념이 상속 될 수있다



발표

Extreme and Sublim 상속은 원래Gregor Mendel에 의해 형성된이 도시는 현대 로투스 바카라학의 기본 개념이되었습니다 로투스 바카라 적 기능성 결함은 오랫동안 대부분 수사적인 것으로 생각되어왔다 haploinsufficiency는 이종 접합체의 로투스 바카라자의 돌연변이로 인해 로투스 바카라자의 기능적 결핍이 거의 로투스 바카라되지 않는 현상이며 (도 1) 초기에 초기에 연구되었다 대립 로투스 바카라자의 한 사본의 손실이 암, 종양 형성, 발달 장애 및 신경계 장애를 포함한 인간 질병을 유발한다는 것이 분명해지면서, 일중성 부전을 나타내는 로투스 바카라자에서 큰 관심을 끌고있다 특히, 많은 연구자들은 게놈에서 얼마나 많은 로투스 바카라자가 haploinsufficiency를 보여주는 지에 관심을 가졌습니다

이 연구에서, 우리는 신진 효모의 이배체 균주를 사용하여 세포 형태를 지표로 사용하여 얼마나 많은 필수 로투스 바카라자가 일배 체제를 나타내는지를 조사했습니다 형태 학적 데이터를 수집 할 때의 조건에서 불일치로 인한 변화를 최소화하기 위해, 완전한 배지에서 배양 된 신진 효모는 초기 로그 단계에서 정확한 타이밍으로 수집되고 자동화 된 이미지 분석 시스템이 사용된다Calmorph(주 10)를 사용하여 각각의 돌연변이 체 균주에 대해 200 개 이상의 세포를 분석 하였다 Calmorph에서 내장 자동 이미지 분류기 및 분류기를 사용하여 고품질 501 차원 형태 학적 정보를 얻을 수있었습니다 결과적으로, 모든 필수 로투스 바카라자 결핍 균주의 59%는 적어도 하나 이상의 형태 학적 특성에서 이상을 나타내는 돌연변이 균주이다 (fdr= 1%, Note 11) 및 최소 매체에서 배양함으로써 새로운 haplo-inficiencies가 추가되었을 때, 75%만큼 새로운 haplo-inficiency를 추가함으로써 haplo-inficiencies를 나타내는 로투스 바카라자가 감지되었다 (그림 2) 이 숫자는 이전 연구에서 9%이며, 세포 증식 속도를 사용하여 계산 된 로투스 바카라자의 백분율은 지수로서 계산되었으며, 이는 많은 수의 필수 로투스 바카라자의 기능적 결함이 명백히 상속되었음을 의미합니다 이 결과는 표현형의 과대 평가 때문이 아니지만 형태 학적 정보는 포함되지 않습니다randomize(주 12)가 반복 된 야생형 실험의 결과와 거의 동일 할 때 얻은 결과를 확인했습니다

왜 그렇게 많은 필수 로투스 바카라자의 기능적 결핍 돌연변이가 명백히 상속되었는지 조사하기 위해, 우리는 형태 학적 표현형 특징을 잘 나타내는 특성을 조사했다 신진 효모의 세포 형태에 관한정량적 특성(주 13)에는 평균값, 백분율을 나타내는 특성 및 분산을 나타내는 특성을 나타내는 특성이 포함됩니다 예를 들어, 딸 세포의 크기, 딸 세포의 평균 크기, 딸 세포가없는 세포의 백분율 및 딸 세포 크기의 분산은 각각입니다 이 중에서, 우리는 많은 필수 로투스 바카라자의 기능적 결함이 분산을 나타내는 많은 특성을 사용하여 명백히 상속된다는 것을 밝혀 냈습니다 (그림 3) 분산을 나타내는 특성은 각 세포의 특성을 조사한 다음 세포 집단의 분산을 계산하여 얻습니다 따라서, 필수 로투스 바카라자의 많은 기능적 결함의 많은 기능적 결함이 더 큰 관점에서 단일 세포 형태 학적 표현형의 정량적 조사에 기인 한 것으로 밝혀졌다

이 연구에서 haploinsufficiency를 나타내는 로투스 바카라자의 경우, haploinsufficiency를 나타내는 로투스 바카라자의 90%, 유사한 기능을 가진 로투스 바카라자의 돌연변이가 유사한 표현형을 나타내지 않을 가능성이 높다긍정적 인 상태 상관 분석이것은 (주 14)에 의해 드러났다 (그림 4) 다시 말해, 일배 체압을 나타내는 대부분의 표현형에는 로투스 바카라자가 누락 된 기능을 알려주는 마크가 있습니다 예를 들어, 제대로 기능하는 데 도움이되는 샤페로닌 복합체는 8 개의 서브 유닛 단백질을 구형 방식으로 수집하여 기능하는 반면 (도 4 좌측), 각 서브 유닛의 이형 접합성 돌연변이 체는 유사한 마커를 가졌다 (도 4 오른쪽) 이 haploinsufficiency 마커를 사용하여 필수 로투스 바카라자의 기능을 자세히 연구 할 수 있습니다 우리는 오랫동안 알려진 로투스 바카라자들 사이의 기능적 관계를 확인할 수있을뿐만 아니라 지금까지 알려지지 않은 기능적 관계를 추론 할 수 있습니다 또한, 우리는 일배일 부족을 나타내는 표현형 유사성을 기반으로 로투스 바카라자 기능 네트워크의 전반적인 그림을 제시 할 수있었습니다 haploinsufficiency에 대한 정보는 향후 복잡한 생물학적 시스템을 분석 할뿐만 아니라 세포 내 약물 표적을 찾는 데 사용될 것으로 기대됩니다

감사의 말

이 연구는 과학 연구 보조금 (15H04402 대표 : Oya Teiichi)에 의해 수행되었습니다

게시 된 잡지

잡지 이름 :PLOS 생물학(온라인 버전은 5 월 16 일에 게시 됨)
논문 제목 :고 차원 단일 세포 표현형이 광범위한 haploinsufficiency
저자 :Shinsuke Ohnuki1, Yoshikazu Ohya1,2*(*해당 저자)
1도쿄 대학교, 새로운 지역 제작 과학 대학원 고급 생명 과학과2연례 고급 산업 과학 및 기술 연구소 AIST 및 University of Tokyo Advanced Offend Measurement Technology Open Innovation Laboratory (Operando-Oil)
doi 번호 : 101371/Journalpbio.2005130
URL :http : //journalsplosorg/plosbiology/article? id = 101371/journalpbio2005130

첨부

그림 1
그림 1 신진 효모의 야생형 및 이형 접합 로투스 바카라자 결핍 균주의 개략도
녹색 선과 파란색 타원은 각각 세포벽과 핵을 나타냅니다 haploinsufficiency를 유발하는 이형 접합 로투스 바카라자 결핍 균주는 올바른 위치에 핵이 없으며 이종 세포벽 모양을 갖는다

그림 2
그림 2 야생형 효모 (+/+) 및 RNA 폴리머 라제 II 서브 유닛의 이형 접합 돌연변이 체 (rpc10/rpc10d)
세포벽, 핵 및 액틴 세포 골격은 각각 녹색, 파란색 및 빨간색으로 표시됩니다 RNA 폴리머 라제의 이형 접합성 돌연변이 체는 세포 수가 더 크고 더 길다는 것이 관찰된다

그림 3
그림 3 관찰 관점의 수와 감지 된 haploinsufficiency 돌연변이 체 사이의 관계
세포 형태 (녹색)의 분산을 나타내는 관점, 평균 (파란색)을 나타내는 관점, 비율 (검은 색)을 나타내는 관점, 분산, 평균 및 백분율 (빨간색)은 모든 필수 로투스 바카라자의 백분율로 표시됩니다

그림 4
그림 4 샤페로닌 복합체의 구조 및 이형 접합 로투스 바카라자 결핍 돌연변이 체의 형태 학적 유사성
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용어집/추가 정보

참고 1 : Sublim, Sublim 상속
대립 로투스 바카라자들 사이에서 특징을 보여주기 어려운 로투스 바카라자는 잠재적이며, 이러한 상속은 잠재 로투스 바카라학이라고합니다 과거에는 열성 또는 열성 로투스 바카라자라고 불 렸지만 로투스 바카라자 사이에 우월성이나 열등 성이 있다는 오해를 피하기 위해 "잠수함"이라고 불렀습니다[참조로 돌아 가기]
주 2 : 필수 로투스 바카라자
이 용어는 로투스 바카라자가 기능이 부족한 경우 자랄 수없는 로투스 바카라자를 말합니다 그것은 증식에 필수적이라는 의미에서 필수 로투스 바카라자라고 불립니다[참조로 돌아 가기]
주 3 : 세포 형태
현미경으로 관찰 될 수있는 세포의 모양과 모양 신진 효모에서, 세포 형태는 세포 골격 중 하나 인 액틴 섬유, 핵 DNA 및 기타 유형의 세포의 염색 이미지로부터 관찰되었다[참조로 돌아 가기]
참고 4 : 명백한, 과도한 상속
대립 로투스 바카라자들 사이에 특징을 보일 가능성이 높은 로투스 바카라자는 명백하며, 이러한 방식으로 상속은 명백한 상속이라고합니다 과거에는 지배적이거나 지배적 인 로투스 바카라자라고 불 렸지만, 로투스 바카라자가 우월하거나 열등감이 있다는 오해를 피하기 위해, 그들은 "외부"라고 불렀습니다[참조로 돌아 가기]
주 5 : 대립 로투스 바카라자
대립 로투스 바카라자 특성을 정의하는 개별 로투스 바카라자[참조로 돌아 가기]
주 6 : 형태 학적 표현형
현미경으로 관찰 될 수있는 세포 특성의 표현 신진 효모에서, 그것은 세포의 외부 형태 및 세포 골격 중 하나 인 액틴 섬유의 염색 이미지 및 핵 DNA에서 읽을 수있는 세포의 특성을 지칭한다[참조로 돌아 가기]
참고 7 : 이종 접합 유형
이배체 유기체에서 다른 대립 로투스 바카라자를 운반하는 상태[참조로 돌아 가기]
주 8 : 로투스 바카라자 결핍 균주
게놈에서 특정 로투스 바카라자를 잃은 유기체 이배체 유기체의 경우, 로투스 바카라자의 하나의 사본 만 손실되면 이형 접합 로투스 바카라자 결핍 균주라고합니다[참조로 돌아 가기]
참고 9 : Haplo-Inficifiency, haplo-Inficiencies
이배체 유기체가 보유하는 로투스 바카라자 쌍 중 하나에서 돌연변이가 발생하더라도, 대부분의 로투스 바카라자는 다른 야생형 로투스 바카라자로부터 생성 된 단백질로 결핍을 포괄하여 돌연변이를 잠재적으로 만듭니다 그러나, 하나의 야생형 로투스 바카라자로부터 생성 된 단백질을 제외하고, 단백질의 양은 충분하지 않으며, 기능은 일반적으로 손상되고 돌연변이로 인해 표현형이 관찰된다 이 현상은 자비전증입니다[참조로 돌아 가기]
참고 10 : Calmorph
신진 효모를 전문으로하는 셀 이미지 분석 시스템 세포벽, 액틴 및 핵을 특이 적으로 검출 할 수있는 형광 시약으로 신진 효모 세포의 3 회 염색 및 수득 된 형광 현미경 이미지의 이미지 분석에 의해 내부 구조를 포함하여 세포 형태를 정량적으로 설명 할 수있다 이 시스템은 단일 세포 수준에서 세포 크기, 마더 셀 및 새싹 크기의 비율 및 핵 위치와 같은 수치 값을 허용 할뿐만 아니라 평균 값, 비율을 나타내는 특성, 분산을 나타내는 특성 등을 나타내는 특성을 포함하여 501 형태 학적 특성에 대한 정량적 조사를 허용합니다[참조로 돌아 가기]
참고 11 : FDR
fdr (거짓 발견 률)는 통계 테스트를 수행하기위한 임계 값입니다 FDR이 1%로 테스트 될 때, 이는 Overt로 검출 된 표현형 수의 거짓으로 감지 된 (거짓 양성)의 백분율의 예상 값이 1%임을 나타냅니다 FDR 근처의 FDR 검출은 잘못된 양성의 수를 감소시킬뿐만 아니라 감지 된 숫자의 수를 감소시켜 오 탐지의 백분율 (False Negatives)의 백분율을 증가시킵니다[참조로 돌아 가기]
주 12 : 무작위 화
무질서한 방식으로 번호 및 기타 데이터 재 배열 이것은 우연히 이벤트가 얼마나 자주 나타나는지를 보여줍니다[참조로 돌아 가기]
참고 13 : 정량적 특성
유기체에 의해 전시 된 다수의 표현형 (특성 및 특성)[참조로 돌아 가기]
참고 14 : 긍정적 및 순방향 상관 관계 분석
이것은 다변량 분석이며, 두 그룹 간의 상관 관계를 증가시키는 가중치를 제공하고 1936 년에 새로운 변수가 합성되고 생성되는 방법입니다hotelling에 의해 고안되었습니다 회귀 분석과 주요 성분 분석을 결합한 방법은 로투스 바카라자 기능과 형태 학적 표현형 사이에 존재하는 관계에 초점을 맞추고,이 둘 사이의 관계를 분석하는 새로운 로투스 바카라자 기능 (GCV) 및 형태 학적 표현형 (PCV)을 정의하는 데 사용될 것입니다 각 GCV 및 PCV는 쌍에서 강하게 상관 관계가 있기 때문에 PCV는 기능 로투스 바카라자가 누락 된 기능을 나타내는 마커로 간주 될 수 있습니다[참조로 돌아 가기]



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