새로운 안전한 바카라 사이트 분석법 및 생물 정보학을 통합하여 대사체 분석을위한 새로운 고 처리량 플랫폼을 성공적으로 개발했습니다! !

Nagoya University (Dean : Kadomatsu Kenji) 의과 대학 (Dean : Kadomatsu Kenji) 및 Tokyo 여성 의과 대학의 Eguchi Moriichiro 조교수, Iguchi Advuchi and aduchi and the aduchi and the aduchi and the avinciation and the wecrnition and the wecrnition and the wecrnition and the wecrnition and schite and the wecrian and wecrnition of adganced and avenced research of advanced research (Dean : kadomats kenji) 및 첨단 연구 연구소 (Dean : Shuto Yoshiyuki) 새로운 안전한 바카라 사이트 분석법 "Probe Electrospray Ionization/Tandem Mass Spectrometry를 사용하여 생물 정보학을 통합하여 내인성 대사 산물을위한 포괄적 인 분석 방법 인"Metabolome Analysis "를위한 새로운 고 처리량 플랫폼을 성공적으로 개발했습니다 R 소프트웨어 기반 데이터 파이프 라인을 사용한 분광법 ")"내인성 대사 산물을위한 포괄적 인 분석 방법 인 "대사 분석"을위한 새로운 고 처리량 플랫폼입니다

이 연구에서, 우리는 24 분에서 복잡한 전처리 수술없이 PESI/MS/MS를 사용하여 glycolysis, TCA 사이클, 펜 토스 포스페이트 경로 및 메티오닌 안전한 바카라 사이트 경로와 관련된 생체 내 안전한 바카라 사이트 경로와 관련된 72 개의 안전한 바카라 사이트 산물 구성 요소를 측정하는 방법을 확립했습니다 또한, 통계 분석 언어 R을 사용하여 생물 정보학을 사용하여, 관심있는 모든 구성 요소, 결과의 다변량 분석 및 그림을 계산하고, VIP 값을 계산하고, VIP 값을 기반으로 VIP 값을 기반으로 테스트 할 수 있도록 VIP 값을 계산하고, 구성 요소를 객관적으로 좁히고, FDR 보정을 위해 중요한 차이 테스트를 수행 할뿐만 아니라, VIP 값을 기반으로 테스트 할 수 있도록 구성 요소를 객관적으로 좁히고, 객관적으로 좁히고, 구성 요소를 수행하고 유의 한 차이를 만들어 냈습니다 분 또한, 간 손상 모델 마우스와 다른 악성 종양이있는 인간 수막 종의 뇌 샘플로부터 간 샘플에 PITMAP를 적용한 결과, 각 병리와 관련된 안전한 바카라 사이트 산물을 성공적으로 추출하고 PITMAP의 실용성을 입증했습니다

PITMAP는 최근 몇 년 동안 많은 관심을 끌고있는 안전한 바카라 사이트 분석을 가능하게하고 모든 사람이 쉽고 신속하게 수행 할 수 있으며 신진 안전한 바카라 사이트 분석을 일반화하는 데 매우 효과적입니다 또한, PITMAP는 안전한 바카라 사이트 질환과 같은 모델 마우스의 빠른 병리학 적 분석 및 수술과 같은 수술 절차 중 수술 중 보조 보조 진단 기술에 대한 적용을 포함하여 광범위한 분야에서 유용 할 것으로 예상된다 또한, 표적 성분을 2 차 안전한 바카라 사이트 산물로 확장함으로써, 최근 몇 년 동안 많은 관심을 끌고있는 식물 과학 및 엑스포 좀 분석에 적용될 것으로 예상된다

이 연구 결과는 Nagoya University Research Enhancement Promotion Project, The Frontier, 새로운 분야의 새로운 분야 (생체 내 실시간 OMICS 실험실, Zaitsu Katsura), Tokyo Women 's Medical University 및 바카라 커뮤니티의 공동 연구를 기반으로합니다분석 화학"

최근안전한 바카라 사이트 분석¹병리학 적 분석 및 약물 독성 메커니즘을 검색하는 데 널리 사용되지만 현재 주로 안전한 바카라 사이트체 분석 측정 시스템에 사용됩니다안전한 바카라 사이트 분석법²사용됩니다 그러나, 안전한 바카라 사이트 분석법을 수행하기 위해서는 복잡한 전처리 작업이 필요하며, 다수의 시편 처리에는 많은 노력과 시간이 필요하므로 대사 분석을위한 높은 처리량이 필요합니다 특히, 안전한 바카라 사이트 분석기 작동은 일반적으로 고도로 전문화되며, 대사 분석을 일반화하기위한 높은 장애물이다 또한, 대사 분석에서 얻은 데이터는 다변량 데이터이며 결과의 해석은 다음과 같습니다다변량 분석³와 같은 분석 방법 필수적입니다

따라서, 안전한 바카라 사이트 분석 용높은 처리량 플랫폼⁴를 구성하려면 빠르고 단순화 된 안전한 바카라 사이트 분석법이 필요합니다Bioinformatics⁵의 통합에 대한 강력한 수요가있었습니다

현재까지, Zaitsu 부교수 등은 연구 그룹에 참여했습니다프로브 전기 분무 이온화 탠덤 안전한 바카라 사이트 분석법 (PESI/MS/MS)⁶를 사용함으로써, 우리는 복잡한 전처리 작업을 수행하지 않고 마우스의 장기 샘플로부터의 안전한 바카라 사이트 산물을 직접 측정 할 수있는 방법을 개발했다 (Zaitsu et al Analytical Chemistry 2016, Hayashi, Zaitsu et al Analytica Chimica Acta 2017) 이 방법은 대상 구성 요소의 샘플링 및 이온화에 미세 바늘을 사용하므로 복잡한 전처리 작업을 수행 할 필요가 없으며 기관 내에서 안전한 바카라 사이트 산물을 직접 측정 할 수 있으므로 고 처리량 분석에 적용 할 수 있습니다 그러나 기존의 방법에서, 표적 구성 요소의 수는 26 개의 구성 요소로 제한되며,이 방법을 안전한 바카라 사이트체 분석으로 적용하기 위해서는 대상 구성 요소의 수를 확장하는 것이 필수적이었습니다 또한 PESI/MS/MS를 사용하여 데이터 수집을 신속하게 수행하더라도 결과를 해석하기 위해서는 다변량 분석 및 유의 한 차이 테스트가 필요했으며, 고 처리량을 달성하기 위해서는 빠른 데이터 분석을 허용하는 생물 정보학의 개발이 필수적이었습니다

새로 개발 된 PITMAP는 액체 크로마토 그래피 탠덤 안전한 바카라 사이트 분석법 (LC/MS/MS)에서 일반적으로 사용되는 "예정된 SRM 메소드⁷"는 처음으로 PESI/MS/MS에 소개되었으며, 마우스와 같은 장기 샘플에서 직접 도입되었습니다당분 해, TCA 사이클, 펜 토스 포스페이트 경로, 베타 산화 경로, 메티오닌 안전한 바카라 사이트 경로와 같은 생체 내 안전한 바카라 사이트 경로⁸와 관련된 안전한 바카라 사이트 산물 72 성분 이제 24 분 안에 측정 할 수 있습니다 게다가,통계 분석 언어 R⁹|를 사용하여 새로 개발 된 생물 정보학에 의해 모든 대상 구성 요소상자 및 수염¹⁰, 다변량 분석 및 시각화 결과,VIP 값¹¹의 계산 VIP 값에 따라 테스트 할 구성 요소를 좁히는 객관적인FDR 교정¹²그리고 1 분 이내에 상당한 차이가 관찰 된 구성 요소에 대한 박스 및 수염 도표의 생성 또한, PITMAP의 실용성을 확인하기 위해, 1) 항 기화 진통제 아세트 아미노펜 (APAP)의 과다 복용에 의해 생성 된 마우스 모델 및 제어 마우스 및 다른 악성 종양을 가진 인간Mediale Species¹³의 뇌 샘플에 적용되었습니다

PITMAP는 APAP- 유도 간 손상 모델 마우스 및 대조군 마우스에서 수행되었으며,도 1에 도시 된 바와 같이, APAP- 유도 간 손상 모델 마우스 및 대조군 마우스 그룹은 잘 분리 된 것으로 나타났다 또한, VIP 값은 테스트 할 성분을 좁히는 데 사용되었으며, 다중 시험을 고려한 유의미한 차이 시험의 결과 (도 2)는 감소 된 글루타티온, 타우린 및 TCA 회로의 성분을 포함하여 29 개 성분의 안전한 바카라 사이트 산물에서 상당한 변화가 발생했음을 보여 주었다 APAP의 활성 안전한 바카라 사이트 산물이며 APAP 유발 간 손상의 독성 몸체로 알려진n-acetyl-4-Benzoquinone Imine (NAPQI)은 글루타티온 접합체에 의해 해독되는 것으로 알려져 있으며,이 연구에서는 APAP 간 손상 모델 마우스에서 감소 된 글루타티온의 현저한 감소가 관찰되었다 또한, APAP- 유도 간 손상은 산화 스트레스가 미토콘드리아 교란에 기여하고 PITMAP가 항산화 타우린의 현저한 감소와 TCA 회로 성분의 상당한 변동을 포착하는 데 성공했음을 시사한다

다음, PITMAP는 다른 악성 종양을 가진 인간 수막 종의 뇌 샘플 (G1-G3)에 적용되었습니다 여기서, 우리는식이 및 기타 요인의 영향을 고려하여 VIP 값을 기반으로 테스트를 거친 성분을 좁히기위한 엄격한 기준을 설정했습니다 PITMAP 실행의 결과와 다변량 분석 결과 (도 3)는 세 그룹이 세 방향으로 분리되었음을 보여 주었으며, 이는 악성 종양의 진행과 안전한 바카라 사이트체의 변화가 연속적이지 않음을 시사한다 또한, 다중 시험을 고려한 유의미한 차이 시험의 결과 (도 4), G1-G2와 G1-G3 사이의 지방산 유형 인 스테아르 산에서 유의 한 차이를 관찰하여 스테 아산이 수막 종의 진행에 따라 스테 아산이 감소한다는 것을 보여준다 안전한 바카라 사이트 산물은 G2와 G3 사이에 유의하게 다른 것으로 밝혀지지 않았지만, 젖산 및 타우린과 같은 유의미한 변화는 G1과 G3 사이에 관찰되었다 암 세포에서 혐기성 호흡이 증가하고 젖산이 축적되는 것으로 일반적으로 알려져 있으며, 암성 G3에서 혐기성 호흡이 증가하여 젖산이 크게 증가한 것으로 생각되었다 또한, 암성 수막 종의 타우린 수치는 암성이 아닌 말초 부위의 타우린 수치보다 높다고보고되었으며, 이는 악성 수막 종과 타우린 변동 사이에 연관성이 있음을 시사한다

결과적으로, 우리는 모델 마우스 및 인간 장기 샘플을 사용하여 PITMAP의 실용성을 성공적으로 시연했습니다

PITMAP는 안전한 바카라 사이트 속도를 높이고 일반화하는 데 매우 효과적이며, 안전한 바카라 사이트 분석을 "쉽고 빠르며 누구에게나"수행 할 수있는 새로운 고 처리량 플랫폼입니다 PITMAP를 사용하면 신경 외과와 같은 수술 절차 동안 수술 중 보조 진단 기술에 대한 적용뿐만 아니라 안전한 바카라 사이트 질환의 마우스 모델의 빠른 병리학 적 분석이 가능할 것으로 예상된다 앞으로 측정 할 구성 요소를 추가함으로써 더 넓은 범위의 포괄적 인 분석이 달성 될 것이며 최근에는 많은 관심을 끌었습니다Exposome Analysis¹⁴에 적용될 것으로 예상됩니다 또한, 미래에는 통계 분석 언어 R을 사용한 생물 정보학을보다 쉽게 ​​구현할 수 있습니다그래픽 사용자 인터페이스 (GUI)¹⁵를 개발하고 구현할 계획입니다

1 안전한 바카라 사이트 분석 :

총 대사 산물 (대사 산물)의 총량은 대사로라고하며, 생체 내에서 대사체의 증가 또는 감소를 종합적으로 분석하는 방법을 대사 분석이라고합니다 일반적으로, 생물학적 샘플로부터 대사 산물 추출 및 농축과 같은 전처리 작업이 수행 된 다음, 가스 크로마토 그래피 안전한 바카라 사이트 분석, 가스 크로마토 그래피 탠덤 안전한 바카라 사이트 분석, 액체 크로마토 그래피 탠덤 안전한 바카라 사이트 분석 등을 사용하여 대사체를 측정한다[참조로 돌아 가기]

2 안전한 바카라 사이트 분석법 :

분석 할 성분이 이온화되고 이온화 된 표적 성분이 전기장 등을 사용하여 안전한 바카라 사이트 의존적 방식으로 분리되는 분석 방법을 지칭합니다 또한 안전한 바카라 사이트 분석을위한 장치를 안전한 바카라 사이트 분광계라고합니다[참조로 돌아 가기]

3 다변량 분석 :

많은 설명 변수 (이 연구에서, 안전한 바카라 사이트 산물)로 구성된 다차원 공간에 플로팅 된 관찰 객체를 투사함으로써 차원을 줄이고 데이터를 시각화하는 방법은 2 차원 평면 등으로 구성된 2 차원으로 구성됩니다 각 그룹은 분리되어 있습니다[참조로 돌아 가기]

4 고 처리량 플랫폼 :

고속으로 데이터 수집을 분석 할 수있는 기본 기술[참조로 돌아 가기]

5 생물 정보학 :

생명 정보 과학으로 번역되며 정보 과학 및 통계를 사용하여 생명 과학 등에서 얻은 데이터를 분석하는 방법과 기술을 나타냅니다[참조로 돌아 가기]

6 프로브 전기 분무 이온화 탠덤 안전한 바카라 사이트 분석법 (PESI/MS/MS) :

Probe Electrospray Ionization은 2007 년 Yamanashi University의 Hiraoka Kenzo 교수가 개발 한 새로운 이온화 방법이며, 700 nm의 팁 직경으로 미세한 바늘을 사용하여 샘플을 수집하고 이온화 할 수 있습니다 탠덤 안전한 바카라 사이트 분석법 (MS/MS)은 "4 차 유형"이라는 3 개의 안전한 바카라 사이트 분리기가 안전한 바카라 사이트 분석기의 안전한 바카라 사이트 분리기에 직렬로 연결되는 장치를 사용하여 수행되는 분석 기술을 나타냅니다 MS/MS는 2 단계 안전한 바카라 사이트 분리를 가능하게하여 이온화 된 표적 성분의 특정 검출을 허용합니다 PESI와 화합물을 식별하는 능력이 높은 탠덤 안전한 바카라 사이트 분석법 (MS/MS)을 결합함으로써 전처리 절차를 수행하지 않고 장기 내에서 관심있는 성분을 직접 검출 할 수 있습니다 2016 년에 Zaitsu 부교수와 다른 연구 그룹은 PESI/MS/MS를 사용하여 세계 최초의 직접 대사 산물 분석 방법을보고했습니다[참조로 돌아 가기]

7 예정된 SRM 방법 :

안전한 바카라 사이트 분광계에서 관심있는 구성 요소를 측정하기 위해서는 관심있는 이온화 성분을 일정 시간 동안 안전한 바카라 사이트 분석기에 가져 가야합니다 따라서 여러 구성 요소를 관찰 할 때 각 구성 요소에 안전한 바카라 사이트 분석기에 통합 할 시간을 할당해야합니다 따라서, 많은 수의 구성 요소가 동시에 측정되면, 구성 요소 당 혼입 시간이 매우 짧아서 목표 구성 요소의 검출 감도가 감소합니다 따라서, 대상 구성 요소를 여러 그룹으로 미리 나누고 동시에 측정 된 대상 구성 요소의 수를 줄임으로써, 대상 구성 요소를 장치에 통합하는 데 짧은 시간을 방지하고 감도의 감소를 피할 수 있습니다 또한, 안전한 바카라 사이트 분석기가 예약되어 한 그룹의 측정이 완료되면 다음 그룹의 목표 구성 요소의 측정이 자동으로 시작되면 민감도를 유지하면서 다수의 대상 구성 요소를 측정 할 수 있습니다 목표 구성 요소 그룹화 및 그룹의 자동 일정을 사용한이 분석 방법을 예약 된 SRM 방법이라고합니다[참조로 돌아 가기]

8 당분 해, TCA 사이클, 펜 토스 포스페이트 경로, 베타 산화 경로 및 메티오닌 안전한 바카라 사이트 경로와 같은 주요 안전한 바카라 사이트 경로 :

당화는 이화 작용을 통해 포도당을 분해하고 에너지를 생성하는 경로입니다 TCA 회로는 미토콘드리아 내에서 에너지를 생산하는 회로이며, 시트르산, α- 케토 글루 타르 산 등을 성분으로 포함합니다 펜 토스 포스페이트 경로는 당화 글루코스 -6- 포스페이트로 이어지는 대안적인 경로이다 메티오닌 안전한 바카라 사이트 경로는 글루타티온 및 타우린과 같은 산화 스트레스에 대한 보호 반응에 작용하는 안전한 바카라 사이트 산물을 생성하기위한 경로이다 이러한 안전한 바카라 사이트 경로는 암 및 약물-유도 간 손상의 메커니즘에 깊은 관여하며, 안전한 바카라 사이트체 분석에서 이러한 안전한 바카라 사이트 경로의 주요 성분의 변화를 종합적으로 관찰하는 것이 매우 중요하다[참조로 돌아 가기]

9 통계 분석 언어 r :

오픈 소스, 무료 소프트웨어의 통계 분석을위한 프로그래밍 언어이며 고속 계산을 수행하는 능력이 특징입니다 다양한 오픈 소스 통계 방법을 사용할 수 있습니다[참조로 돌아 가기]

10 상자 및 수염 도표 :

데이터의 중간 값과 총 데이터의 75% 및 25%를 보여주는 "박스"를 사용하여 전체 데이터의 변동을 시각화하는 데 사용되는 다이어그램, 최대 및 최소 데이터 값을 보여주는 "수염"[참조로 돌아 가기]

11 VIP 값 :

PLS (proceings to the -prositent structures) 모델에서, 가변적 중요성 투영에 대한 약어이며 다변량 분석 방법, 설명 변수의 기여 (예 : 그룹 분리에 대한 안전한 바카라 사이트 학적 분석의 각 안전한 바카라 사이트 산물)는 수량으로 표시 될 수 있습니다[참조로 돌아 가기]

12 FDR 보정 :

테스트가 여러 번 반복되면, 잘못된 판단의 확률은 설정된 유의 수준에서 발생하는 것으로 알려져 있으며 (일반적으로 005) 증가합니다 (유형 1 오류 (알파 오류)라고 함)이를 시험의 다중화 문제라고합니다 이러한 "테스트의 다중 공장"을 피하는 한 가지 방법은 FDR (False Discovery rate)을 조정하는 것입니다 이는 테스트가 여러 번 반복 되더라도 전체 패밀리 오류율 (패밀리 오류율)이 005를 초과하는 것을 방지하는 것입니다 또한 유의 확률 (p- 값)은 일반적으로 Q 값으로 표현되므로 FDR 보정 후 수정 된 값으로 알려져 있습니다[참조로 돌아 가기]

13 수막 종 :

뇌를 덮는 수막에서 비롯된 뇌종양이며, 발생의 원인은 잘 알려져 있지 않습니다 악성 변형은 시간이 지남에 따라 발생할 수 있으며, 세계 보건기구 (WHO)에 의해 악성 종양에 따라 양성에서 악성으로 3 개의 등급 (G1, G2 및 G3)으로 분류됩니다[참조로 돌아 가기]

14 엑스포 좀 분석 :

내인성 물질, 신체에 존재하는 외인성 물질 분석 및 통합 방법[참조로 돌아 가기]

15 그래픽 사용자 인터페이스 (GUI) :

화면에 표시되는 시각적 도구를 사용하여 컴퓨터에 대한 지침을 쉽게 실행할 수있는 기술 여기에서는 사용자가 통계 분석 언어 R에서 시각적으로 수행되는 프로세스를 실행할 수있는 기술을 나타냅니다[참조로 돌아 가기]