게시 및 게시 날짜 : 2022/08/30

Covid-19 감염을 바카라 족보하는 감지 된 펩티드

-나는 스파이크 단백질에서 돌연변이 될 가능성이 적고 다양한 돌연변이 균주에 대해 효과적인 부위에서 작용하는 바카라 족보제를 개발하기를 기대한다

포인트

  • 바이러스의 스파이크 단백질을 집계하여 기존 및 omicron 균주의 감염 바카라 족보로 이어집니다
  • 스파이크 단백질에서 설탕 사슬과 아미노산을 동시에 인식하고 강하게 작용합니다
  • 다음 전염병 준비

요약 다이어그램

펩티드 (PHOSL)에 의한 스파이크 단백질의 응집 및 COVID-19 감염의 바카라 족보 속도


요약

Yamazaki Kazuhiko, Chief Researcher, Kubota Tomomi, Chief Researcher, Researcher, Tateno Hiroaki, Research Group, Director of the Cellular and Molecular Engineering Research Division, Nagasaki University, Professor Morita Koichi, Dejima Special Zone, Infectious Disease Research Institute, Nagasaki University, Associate Professor Ngwe Tun, Mya Myat, Myat, Myat, 연구원, 연구 당시 소재 구조 과학 연구소 (Adachi Narihiko) 연구소의 연구소, Moriya Toshio 부교수, Moriya Toshio 부교수, Ikeda Sato, 연구원 인 Ikeda Sato 부교수는 소설의 전통 및 Omicron Strain의 감염 능력을 가진 펩티드 분자를 발견했습니다

이 펩티드는스파이크 단백질Openn Type Sugar스파이크 단백질 중에서, 글리 칸이 첨가되는 부위는 돌연변이를 겪을 가능성이 적다는 것이 알려져 있으며, 결과적으로,이 펩티드의 작용은 또한 돌연변이에 대해 강한 것으로 나타났습니다 이 펩티드를 출발점으로 사용하면 향후 발생할 수있는 새로운 돌연변이에 반응 할 수있는 바카라 족보제의 생성에 기여합니다

이 기술의 세부 사항은 2022 년 8 월 25 일에 제공 될 예정입니다The Febs Journal"


개발의 사회적 배경

일본의 코로나 바이러스 감염은 사례가 증가하거나 감소하는 물결을 겪고 있으며, 일곱 번째 물결은 감염된 사람들의 가장 많은 수를 기록했습니다 다수의 예방 접종은 심각도 속도를 낮게 유지했지만, 바이러스 돌연변이는 백신 접종 백신을 만들고 승인 된 항체 약물을 덜 효과적으로 만들었다는 것이 밝혀졌다 이는 항체에 의해 표적 된 스파이크 단백질이 돌연변이가 발생하기 쉽기 때문에 돌연변이에 따라 미래에 심각한 상황에 처할 위험이 있습니다 대조적으로, 경구 약물로서 사용될 수있는 소분자 약물은 바이러스 성 프로테아제 및 폴리머 라제를 표적으로하고 돌연변이에 상대적으로 내성 인 것으로 알려져 있지만, 조합 기충의 존재와 같은 단점이있다 이들 소분자 및 항체 약물 중 일부는 인플루엔자와 같은 다른 바이러스 감염성 질환 치료 및 SARS 환자의 항체에 기초하여 현재 전염병 이전에도 발달하고있다 다시 말해, Covid-19가 가까운 시일 내에 해결 되더라도 치료 약물 개발을 목표로하는 지속적인 연구는 다음 전염병을위한 준비로 생각됩니다

 

연구 이력

바카라 족보는 Glycan 인식 단백질의 특이성 및 결합 강도를 종합적으로 분석하고 의료 응용 프로그램에 적용하는 시스템을 개발했습니다 이 중에서, Sugitake (Pholiota Squarrosalection : phosl) 및 글리 칸의 특정 인식 메커니즘은 입체 구조 분석을 통해 설명되었습니다 이 펩티드는 40 개의 아미노산으로 구성되며 화학적 합성을 통해 비 천연 아미노산을 함유하는 분자를 쉽게 변형시키는 능력이 특징입니다 또한, 해외 연구는 PhoSL이 소설 코로나 바이러스 (Core F 코스)가 볼 수 있음이 밝혀졌습니다

Nagasaki University는 분자 메커니즘을 분석하고 뎅기 바이러스와 같은 다양한 병원성 바이러스에 대한 병원성을 평가하기 위해 노력하고 있습니다 Covid-19의 확산으로, 우리는 또한 감염 바카라 족보제 분자의 활동을 평가하고있다

고 에너지 가속기 연구소냉동 전자 현미경의 공동 사용 기반으로서, 우리는 국내 사용자와 바이오 폴리머 시스템의 3 차원 구조 분석을 수행하고 있습니다

이번에는, 우리는 새로운 코로나 바이러스 스파이크 단백질 및 phosl의 결합을 정량적으로 분석하고, 결합으로 인해 응집이 발생한다는 것을 관찰했으며, PhOSL이 새로운 코로나 바이러스의 감염을 바카라 족보하는 능력이 있음을 발견 하였다

이 연구 및 개발은 과학 연구 보조금 (b)), "새로운 Glycan Target Probes (2018-2021)를 만들어 의료 응용 기술 개발"및 일본 의료 연구 개발 고급 기술 지원 플랫폼 (BINTS)에 의해 지원됩니다

 

연구 컨텐츠

현재의 발견은 N- 타입 글리 칸의 핵심 푸코스 구조를 구체적으로 인식하는 펩티드 (PHOSL)가 신규 한 코로나 바이러스의 스파이크 단백질에서 글리 칸에 결합하고 응집체에 결합하여 바이러스에 의한 세포 감염을 바카라 족보한다는 것이다 기존의 균주와 Ommicron 균주는 모두 PhOSL 결합 및 감염 바카라 족보에서 유사한 활성을 나타냈다

10731_10818해리 상수약 4 nm에서 매우 강한 결합 활동이 발견되었습니다 이것은 Phosl이 설탕 사슬에만 결합하는 것보다 약 1000 배 더 활성입니다

그림 1

그림 1 (왼쪽) 코어 푸코스 구조 (레드 : 푸 코스, 파란색 : N- 아세틸 글루코사민, 노란색 : Mannose)는 PhOSL 트리머가 구체적으로 결합하고 (오른쪽) 표면 플라즈몬 공명 방법에 의해 스파이크 단백질에 결합하는 (오른쪽)에 결합합니다

다음으로, 냉동 전자 현미경을 사용하여 결합 상태를 관찰하려고 할 때, 우리는 PhOSL이없는 경우 스파이크 단백질 입자가 관찰되었음을 발견 한 반면, PhOSL은 유의 한 응집체를 보여 주었다 (도 2) 따라서 우리는 영장류 배양 세포주를 사용했습니다prnt assay기존의 균주와 Ommicron 균주는 모두 유사한 감염 바카라 족보 활성을 나타냈다

그림 2

냉동 전자 현미경 (PHOSL 및 PHOSL의 첨가) 및 (오른쪽) PRNT 분석에 의한 스파이크 단백질의 그림 2 (왼쪽, 중간) 이미지

추가로분자 역학 계산를 사용하여 PhOSL과 스파이크 단백질 사이의 상호 작용을 시뮬레이션했을 때, 우리는 그것이 스파이크 단백질의 설탕 사슬뿐만 아니라 단백질 부분과 상호 작용한다는 것을 발견했습니다 이것은 설탕 사슬 단독 인 것보다 더 강한 결합력과 관련이있는 것으로 생각됩니다

그림 3

그림 3 분자 역학 계산에 의한 PHOSL 및 스파이크 단백질 (수용체 결합 도메인: RBD) 상호 작용 단백질 부분과 밀접한 상호 작용을 형성 할뿐만 아니라 (색상은 그림 1에서와 동일) 단백질 부분 (빨간색 선입니다소수성 상호 작용, 파란색 선은수소 결합)

글리코 실화 부위가 돌연변이 될 가능성이 적기 때문에, 글리코 실화 펩티드 인 Phosl은 다양한 돌연변이 균주에 대한 효과적인 광범위한 스펙트럼 바카라 족보제가 될 수있다 또한, PHOSL이 부 자연스러운 아미노산을 변형시킴으로써 단백질과의 상호 작용을 향상시킬 수 있다면, 더 강한 바카라 족보 효과를 생성 할 것으로 예상 될 수있다

*이 보도 자료의 그림 1-3은 원래 논문 "Core Fucose-SpecificPholiota SquarrosaSARS-COV-2 감염의 강력한 광범위한 스펙트럼 바카라 족보제로서의 렉틴 (PHOSL)은 사용됩니다

 

미래 계획

앞으로, 우리는 스파이크 단백질에 대한 결합을 향상시키고 감염 바카라 족보 활성을 향상시키기 위해 구조적 정보를 기반으로 PHOSL을 수정할 계획이다 이것은 PHOSL의 바이러스 감염에 대한 치료 또는 진단제로 사용되는 것을 목표로 할 것이다

 

기사 정보

게시 된 잡지 :The Febs Journal
논문 제목 : 핵심 푸스 특이 적Pholiota SquarrosaSARS-COV-2 감염의 강력한 광범위한 스펙트럼 바카라 족보제로서의 렉틴 (PHOSL)
저자 : Yamazaki Kazuhiko, Yasutoshihiko, Ngwe Tun, Mya Myat, Ikeda Satoto, Moriya Toshio, Kawasaki Masato, Yamazaki Tomoko, Kubota Tomomi, Nagashima Osamu, Shimizu Hiroki, Topateno hiroi, hiroki Koichi


용어집

스파이크 단백질
바이러스 입자의 외부 껍질에 존재하고 감염된 세포의 수용체에 결합하여 바이러스 침습을 유발하는 단백질 항체의 표적 인 것으로 알려져 있지만 바이러스 돌연변이로 구성된 아미노산은 쉽게 변경됩니다 삼량 체를 형성합니다[참조로 돌아 가기]
N 형 설탕 사슬
단백질을 구성하는 아미노산 중 아스파라긴에 첨가 된 당 사슬에 대한 일반적인 용어 새로운 코로나 바이러스 스파이크 단백질은 사슬 당 22 개의 N 형 글리 칸 (삼량 체 당 66)을 함유한다[참조로 돌아 가기]
코어 F 코스
푸 코스가 N- 타입 글리 칸의 코어 영역의 가장 기본적인 N- 아세틸 글루코사민 (3 개의 만노스 및 2 개의 N- 아세틸 글루코사민으로 구성된 뿌리 부분; 그림 1의 왼쪽)에 첨가되는 구조 주로 2 개의 N- 아세틸 글루코사민 및 푸 코스로 구성된 삼분기 부분이 인식된다[참조로 돌아 가기]
Cryo-Electron Microscope
샘플이 액체 질소 온도에서 냉동되어 측정되는 전자 현미경 3 차원 구조 모델은 기초 표면에 다양한 각도로 배열 된 분자의 이미지 데이터를 수집하여 구성 할 수 있습니다 이 연구는 고 에너지 가속기 연구소의 냉동 전자 현미경을 사용했습니다[참조로 돌아 가기]
해리 상수
결합 친화력의 측정 값은 낮은 값이 더 강하다는 것을 나타냅니다 1 : 1 결합 모델에서, 그것은 [a] [b]/[ab] ([a]는 분자 A이며, [b]는 분자 B이고, [ab]는 복합체의 평형 상태에서의 농도)로 표현된다[참조로 돌아 가기]
prnt assay
플라크 감소 중화 테스트 바이러스 감염에 의해 야기 된 배양 된 세포 판에 대한 플라크 수를 감소시키는 바카라 족보제의 첨가 효과를 평가하는 방법[참조로 돌아 가기]
분자 역학 계산
형태 정보에 기초하여 뉴턴의 운동 방정식을 순차적으로 해결함으로써 분자의 운동을 계산하는 방법[참조로 돌아 가기]
수용체 결합 도메인
감염된 세포에서 수용체 (안지오텐신-수색 효소 2, ACE2)에 결합하는 약 200 개의 아미노산의 영역 여기서 돌연변이는 수용체의 특성을 변화시키고 감염성을 증가시킬 수 있습니다 2 개의 N 형 글리 칸이 첨가되며 대부분 코어 포스 구조가 있습니다[참조로 돌아 가기]
소수성 상호 작용 및 수소 결합
생물학적 폴리머 사이의 친화력의 이름 전자는 지질과 후자의 친수성 분자 사이의 인력의 힘에 해당한다[참조로 돌아 가기]


문의

연락처 양식