게시 및 게시 날짜 : 2023/04/27

일본 주변의 물에서 붉은 산호의 스피드 바카라자 집단 구조 중 일부가 드러납니다

-붉은 산호의 보존에 대한 조정-

포인트

  • 일본 주변의 물에서 단일 뉴클레오티드 다형성 정보를 사용한 집단 스피드 바카라자 분석 및 유충 분산 시뮬레이션
  • 스피드 바카라 적 다양성이 낮은 집단은 발견되지 않았으며, 스피드 바카라자 상호 작용이 넓은 지역에서 유지되는 것으로 밝혀졌다
  • 애벌레 분산 시뮬레이션과 결합 된 분석은 다른 그룹과의 상호 작용이 제한된 인구의 존재를 보여줍니다

요약 다이어그램

왼쪽 : 애벌레 분산 시뮬레이션의 예 오른쪽 : 단일 뉴클레오티드 다형성 정보를 사용한 주요 성분 분석 (각 지점 사이의 거리는 스피드 바카라 적 차이를 반영 함)
*해양 과학의 프론티어잡지에 게시 된 수정 된 다이어그램


요약

Kise Hiroki, AIST 특수 연구원 (연구 당시), Iguchi Ryo, Saito Naoki, Suzuki Jun Research Group의 Saito Naoki 최고 연구원, Rissho University의 Semi-Endicational Assicated의 인구 분석을 수행했습니다 (NT), 일본 주변의 5 개 물에서 수집 된 샘플을 사용합니다 또한, 해수 흐름 모델을 사용하여 애벌레 분산을 시뮬레이션하여 각 집단 간의 상호 작용 관계를 평가했습니다 결과는 스피드 바카라자 분화가 각 집단, 특히 쿠로시오 채널에 위치한 집단 사이에서 검출되지 않았으며 스피드 바카라자 교환이 널리 유지됨을 보여 주었다 한편, 일부 그룹은 Kuroshio Current Channel에서 출발하여 다른 지역과의 상호 작용이 제한되어 있음이 분명해졌습니다 이 연구에서 얻은 결과는 붉은 산호를 보존하기위한 중요한 통찰력입니다 이 결과는 2023 년 4 월 27 일 (일본 시간)에 이루어졌습니다해양 과학의 프론티어잡지에 게시 (디지털 버전)


연구 배경

붉은 산호는 외경 계급의 산호 가족에 속하는 끈적 끈적한 cnidarian (그림 1)이며 일본의 Sagami Bay에서 남쪽으로 75-300m의 깊이에 해저에 거주합니다 이 종은 보석 산호로도 알려져 있으며 일본에서 오랫동안 장식으로 사용되어 왔으며 중요한 경제적, 문화적 가치가 있습니다 그러나 수년에 걸쳐 과도한 물고기의 어획으로 인해 주식 금액이 감소 할 것이라는 우려가있었습니다 따라서 현재 환경부에서 선택한 빨간색 목록에서 "거의 멸종 위기에 처한 (NT)"로 분류됩니다 또한 중국산 빨간 산호이 가능워싱턴 조약에 출판 된 국제 무역이 규제됩니다

스피드 바카라 적 다양성은 유기체 건강의 지표이며 변동하는 환경에 적응하는 원동력입니다 일반적으로 특정 인구의 유기체 인구가 극적으로 떨어지면 근친 교배 및 기타 요인의 영향으로 인해 스피드 바카라 적 다양성이 감소하여 환경 변화에 반응하기가 어렵다는 것이 일반적으로 알려져 있습니다 스피드 바카라자 다양성은 또한 다양한 스피드 바카라자를 가진 개인 간의 상호 작용 (스피드 바카라자 교환)을 통해 유지됩니다 따라서 스피드 바카라자 다양성과 스피드 바카라자 교환의 정도를 이해하는 것은 유기체의 적절한 보존에 유용한 정보입니다 그러나 일본 주변의 물에서 스피드 바카라 적 다양성과 스피드 바카라자 교류에 대한 연구는 거의 수행되지 않았습니다

그림 1

그림 1 보석 코랄로 알려진 붉은 산호 그룹

연구 컨텐츠

9904_9998rad-seq| 핵 게놈에서 그것을 찾는 데 사용됩니다단일 뉴클레오티드 다형성 정보추출되었고 스피드 바카라자 집단 구조를 검사 하였다 또한, 우리는 해수 흐름 모델 JCOPE2M (일본 해양 연구 개발)을 사용하여 애벌레 분산 시뮬레이션을 수행했으며, 이는 2019 년부터 2021 년까지 Kuroshio 전류 흐름에 주로 초점을 맞추고 그룹 간의 상호 작용 관계를 평가하기 위해 스피드 바카라자 분석 결과와 비교했습니다

그림 2

그림 2 연구에 사용 된 붉은 산호가 수집 된 위치
*해양 과학의 프론티어잡지에 게시 된 수정 된 다이어그램

RAD-SEQ를 사용한 집단 스피드 바카라자 분석 결과는 카가 고시마와 아마미 오시마의 집단 간의 스피드 바카라자 조성의 차이를 보여 주었고, 카가 고시마의 일부 그룹은 두 그룹 사이에 흐르는 쿠로시오 전류의 영향으로 인해 유 전적으로 분리 될 수 있다고 생각되었다 (그림 3)

그림 3

그림 3 각 집단 간의 스피드 바카라 적 차이는 스피드 바카라 적 분화 측정입니다fstfst낮은 값 (연한 파란색), 즉 많은 장소가 인구간에 작은 스피드 바카라 적 차이를 가지고 있으며, 이는 스피드 바카라자 교환이 넓은 범위에 걸쳐 유지됨을 나타냅니다 한편, 카가 고시마와 아마미 오시마에서 가장 높은 것은 다음과 같습니다fst값 (빨간색)이 감지되었으며, 이는 두 집단 사이에서 비교적 큰 스피드 바카라 적 차이가 발견됨을 나타냅니다
*해양 과학의 프론티어잡지에 게시 된 수정 된 다이어그램

반면에, 그것은 스피드 바카라 적 다양성의 척도입니다이종 접합 학위모든 인구에서 약 008-01이었고, 이번에 검사 된 적색 산호 집단에서 특히 스피드 바카라 적 다양성이 특히 낮은 인구는 발견되지 않았다 또한, 스피드 바카라자 흐름의 양과 방향을 분석하면 그룹 (특히 Kuroshio 전류 채널에 위치한 그룹) 간의 스피드 바카라자 교환이 널리 유지된다는 것이 밝혀졌습니다 또한, 유충 산란의 시뮬레이션에서, 그룹들 사이에서 유충을 이동하는 것으로 보이는 입자는 인구 스피드 바카라자 분석 결과를지지한다 오 가사와라 인구는 다른 그룹과 지리적으로 분리되어 있지만 스피드 바카라자 분석은 다른 그룹과 상호 작용할 수 있음을 시사합니다 그러나 이번에 우리가 분석 한 오 가사 사라의 인구 수는 적기 때문에 향후 추가적인 추가 분석이 필요합니다 이 연구의 결과는 붉은 산호의 보존을 고려할 때 중요한 기본 지식으로 사용될 것으로 예상됩니다

그림 4

그림 4 애벌레 분산 시뮬레이션의 예 유충과 유사한 입자의 움직임을 보여줍니다 빨간색 별은 입자 방출 지점을 나타내고 오렌지 별은 샘플링 지점을 나타냅니다 연한 파란색 선은 유충 궤적을 나타냅니다
*해양 과학의 프론티어잡지에 게시 된 다이어그램 추가

이 연구는 일본 과학 홍보를위한 일본 사회 (독일) 일본 과학 홍보 협회 (17K07274 : 대표 : NOZOMI IWASAKI), 농업부, 어업, 어업, 어업, 어업 정책을 촉진하기위한 농업 및 어업의 실용 기술 개발 프로젝트 (220322) Ogasawara 주변의 바다 지역의 보석과 산호에 대한 조치 및 AIST 환경 친화적 인 산업 기술 연구소 (E-Code)

 

기사 정보

게시 된 잡지 :해양 과학의 프론티어
논문의 제목 : 북서 태평양에서 귀중한 Coral Corallium japonicum의 스피드 바카라자 집단 구조
저자 : Hiroki Kise, Akira Iguchi, Naoki Saito, Yuki Yoshioka, Koji Uda, Tomohiko Suzuki, Atsushi J Nagano, Atsushi Suzuki, Nozomu Iwasaki
doi : 103389/fmars20231052033


용어집

워싱턴 조약
멸종 위기에 처한 야생 식물 군과 식물 군의 국제 무역 협약에서 보호되는 데 필요한 야생 식물과 동물은 부록 I, II 및 III로 분류됩니다[참조로 돌아 가기]
rad-seq
차세대 시퀀싱 기술을 사용하여 고속 및 저렴한 비용으로 게놈의 특정 영역을 분석하는 방법[참조로 돌아 가기]
단일 뉴클레오티드 다형성
상 동성 개체 간의 게놈 DNA의 염기 서열을 비교할 때, 한 염기를 다른 염기로 대체하는 것을 단일 뉴클레오티드 다형성이라고합니다 그것은 집단 스피드 바카라자 및 분자 계통 발생 학적 분석에 널리 사용됩니다 단일 뉴클레오티드 다형성 정보를 검사함으로써 각 개인이 서로 얼마나 밀접하게 관련되어 있는지 쉽게 알 수 있습니다[참조로 돌아 가기]
이종 접합성
인구에서 상 동성 스피드 바카라자좌를 검사했을 때 상이한 대립 스피드 바카라자 (다른 스피드 바카라자 정보를 가진 스피드 바카라자)를 가진 개인의 비율[참조로 돌아 가기]


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